Protein–RNA interactions for Protein: A6PVI3

NCBP2L, Nuclear cap-binding protein subunit 2-like, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCBP2LA6PVI3 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NCBP2LA6PVI3 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NCBP2LA6PVI3 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NCBP2LA6PVI3 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NCBP2LA6PVI3 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NCBP2LA6PVI3 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NCBP2LA6PVI3 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NCBP2LA6PVI3 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NCBP2LA6PVI3 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NCBP2LA6PVI3 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NCBP2LA6PVI3 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NCBP2LA6PVI3 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NCBP2LA6PVI3 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NCBP2LA6PVI3 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NCBP2LA6PVI3 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NCBP2LA6PVI3 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NCBP2LA6PVI3 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NCBP2LA6PVI3 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NCBP2LA6PVI3 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NCBP2LA6PVI3 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NCBP2LA6PVI3 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NCBP2LA6PVI3 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NCBP2LA6PVI3 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NCBP2LA6PVI3 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NCBP2LA6PVI3 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NCBP2LA6PVI3 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NCBP2LA6PVI3 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NCBP2LA6PVI3 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NCBP2LA6PVI3 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NCBP2LA6PVI3 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NCBP2LA6PVI3 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NCBP2LA6PVI3 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NCBP2LA6PVI3 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NCBP2LA6PVI3 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NCBP2LA6PVI3 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NCBP2LA6PVI3 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NCBP2LA6PVI3 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
NCBP2LA6PVI3 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NCBP2LA6PVI3 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NCBP2LA6PVI3 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NCBP2LA6PVI3 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NCBP2LA6PVI3 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NCBP2LA6PVI3 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NCBP2LA6PVI3 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NCBP2LA6PVI3 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NCBP2LA6PVI3 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NCBP2LA6PVI3 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NCBP2LA6PVI3 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NCBP2LA6PVI3 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NCBP2LA6PVI3 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NCBP2LA6PVI3 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NCBP2LA6PVI3 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NCBP2LA6PVI3 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NCBP2LA6PVI3 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NCBP2LA6PVI3 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NCBP2LA6PVI3 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NCBP2LA6PVI3 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NCBP2LA6PVI3 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NCBP2LA6PVI3 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
NCBP2LA6PVI3 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
NCBP2LA6PVI3 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NCBP2LA6PVI3 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NCBP2LA6PVI3 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NCBP2LA6PVI3 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NCBP2LA6PVI3 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NCBP2LA6PVI3 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NCBP2LA6PVI3 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NCBP2LA6PVI3 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NCBP2LA6PVI3 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NCBP2LA6PVI3 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NCBP2LA6PVI3 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NCBP2LA6PVI3 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NCBP2LA6PVI3 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NCBP2LA6PVI3 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NCBP2LA6PVI3 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NCBP2LA6PVI3 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NCBP2LA6PVI3 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NCBP2LA6PVI3 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NCBP2LA6PVI3 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NCBP2LA6PVI3 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NCBP2LA6PVI3 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NCBP2LA6PVI3 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NCBP2LA6PVI3 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NCBP2LA6PVI3 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
NCBP2LA6PVI3 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NCBP2LA6PVI3 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
NCBP2LA6PVI3 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
NCBP2LA6PVI3 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NCBP2LA6PVI3 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NCBP2LA6PVI3 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NCBP2LA6PVI3 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NCBP2LA6PVI3 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NCBP2LA6PVI3 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NCBP2LA6PVI3 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NCBP2LA6PVI3 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NCBP2LA6PVI3 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NCBP2LA6PVI3 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NCBP2LA6PVI3 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NCBP2LA6PVI3 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NCBP2LA6PVI3 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 169.8 ms