Protein–RNA interactions for Protein: A6NIE9

PRSS29P, Putative serine protease 29, humanhuman

Predictions only

Length 313 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRSS29PA6NIE9 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PRSS29PA6NIE9 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PRSS29PA6NIE9 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
PRSS29PA6NIE9 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PRSS29PA6NIE9 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PRSS29PA6NIE9 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PRSS29PA6NIE9 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PRSS29PA6NIE9 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PRSS29PA6NIE9 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PRSS29PA6NIE9 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PRSS29PA6NIE9 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PRSS29PA6NIE9 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PRSS29PA6NIE9 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PRSS29PA6NIE9 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PRSS29PA6NIE9 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PRSS29PA6NIE9 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PRSS29PA6NIE9 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PRSS29PA6NIE9 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PRSS29PA6NIE9 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
PRSS29PA6NIE9 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PRSS29PA6NIE9 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PRSS29PA6NIE9 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PRSS29PA6NIE9 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PRSS29PA6NIE9 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PRSS29PA6NIE9 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PRSS29PA6NIE9 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PRSS29PA6NIE9 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PRSS29PA6NIE9 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PRSS29PA6NIE9 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PRSS29PA6NIE9 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PRSS29PA6NIE9 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PRSS29PA6NIE9 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PRSS29PA6NIE9 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PRSS29PA6NIE9 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PRSS29PA6NIE9 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PRSS29PA6NIE9 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PRSS29PA6NIE9 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PRSS29PA6NIE9 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PRSS29PA6NIE9 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PRSS29PA6NIE9 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PRSS29PA6NIE9 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PRSS29PA6NIE9 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PRSS29PA6NIE9 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PRSS29PA6NIE9 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PRSS29PA6NIE9 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PRSS29PA6NIE9 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PRSS29PA6NIE9 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PRSS29PA6NIE9 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PRSS29PA6NIE9 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PRSS29PA6NIE9 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PRSS29PA6NIE9 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PRSS29PA6NIE9 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PRSS29PA6NIE9 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PRSS29PA6NIE9 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PRSS29PA6NIE9 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PRSS29PA6NIE9 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
PRSS29PA6NIE9 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PRSS29PA6NIE9 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PRSS29PA6NIE9 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PRSS29PA6NIE9 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PRSS29PA6NIE9 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
PRSS29PA6NIE9 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PRSS29PA6NIE9 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PRSS29PA6NIE9 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PRSS29PA6NIE9 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PRSS29PA6NIE9 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PRSS29PA6NIE9 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PRSS29PA6NIE9 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PRSS29PA6NIE9 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PRSS29PA6NIE9 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PRSS29PA6NIE9 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PRSS29PA6NIE9 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PRSS29PA6NIE9 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PRSS29PA6NIE9 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
PRSS29PA6NIE9 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PRSS29PA6NIE9 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PRSS29PA6NIE9 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PRSS29PA6NIE9 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
PRSS29PA6NIE9 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
PRSS29PA6NIE9 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PRSS29PA6NIE9 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PRSS29PA6NIE9 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PRSS29PA6NIE9 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PRSS29PA6NIE9 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PRSS29PA6NIE9 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PRSS29PA6NIE9 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PRSS29PA6NIE9 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PRSS29PA6NIE9 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PRSS29PA6NIE9 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PRSS29PA6NIE9 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PRSS29PA6NIE9 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PRSS29PA6NIE9 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PRSS29PA6NIE9 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PRSS29PA6NIE9 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PRSS29PA6NIE9 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
PRSS29PA6NIE9 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PRSS29PA6NIE9 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PRSS29PA6NIE9 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PRSS29PA6NIE9 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PRSS29PA6NIE9 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms