Protein–RNA interactions for Protein: A6NFD8

HELT, Hairy and enhancer of split-related protein HELT, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELTA6NFD8 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HELTA6NFD8 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HELTA6NFD8 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HELTA6NFD8 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
HELTA6NFD8 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
HELTA6NFD8 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
HELTA6NFD8 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HELTA6NFD8 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HELTA6NFD8 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HELTA6NFD8 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HELTA6NFD8 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HELTA6NFD8 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HELTA6NFD8 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HELTA6NFD8 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HELTA6NFD8 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HELTA6NFD8 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HELTA6NFD8 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HELTA6NFD8 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HELTA6NFD8 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HELTA6NFD8 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HELTA6NFD8 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
HELTA6NFD8 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HELTA6NFD8 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HELTA6NFD8 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HELTA6NFD8 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HELTA6NFD8 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HELTA6NFD8 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HELTA6NFD8 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HELTA6NFD8 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HELTA6NFD8 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HELTA6NFD8 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HELTA6NFD8 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HELTA6NFD8 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HELTA6NFD8 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HELTA6NFD8 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HELTA6NFD8 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HELTA6NFD8 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HELTA6NFD8 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HELTA6NFD8 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HELTA6NFD8 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HELTA6NFD8 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HELTA6NFD8 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HELTA6NFD8 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HELTA6NFD8 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HELTA6NFD8 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HELTA6NFD8 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HELTA6NFD8 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HELTA6NFD8 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HELTA6NFD8 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HELTA6NFD8 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HELTA6NFD8 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HELTA6NFD8 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HELTA6NFD8 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HELTA6NFD8 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HELTA6NFD8 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HELTA6NFD8 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HELTA6NFD8 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HELTA6NFD8 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
HELTA6NFD8 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HELTA6NFD8 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HELTA6NFD8 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HELTA6NFD8 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HELTA6NFD8 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HELTA6NFD8 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HELTA6NFD8 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HELTA6NFD8 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HELTA6NFD8 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HELTA6NFD8 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HELTA6NFD8 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
HELTA6NFD8 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HELTA6NFD8 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
HELTA6NFD8 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HELTA6NFD8 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
HELTA6NFD8 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC21.28■■□□□ 1
HELTA6NFD8 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HELTA6NFD8 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HELTA6NFD8 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HELTA6NFD8 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HELTA6NFD8 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HELTA6NFD8 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HELTA6NFD8 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HELTA6NFD8 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HELTA6NFD8 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HELTA6NFD8 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HELTA6NFD8 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HELTA6NFD8 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HELTA6NFD8 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HELTA6NFD8 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HELTA6NFD8 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HELTA6NFD8 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HELTA6NFD8 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HELTA6NFD8 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HELTA6NFD8 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HELTA6NFD8 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HELTA6NFD8 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HELTA6NFD8 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HELTA6NFD8 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HELTA6NFD8 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HELTA6NFD8 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HELTA6NFD8 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.2 ms