Protein–RNA interactions for Protein: A6NDN3

GOLGA6B, Golgin subfamily A member 6B, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6BA6NDN3 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
GOLGA6BA6NDN3 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
GOLGA6BA6NDN3 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
GOLGA6BA6NDN3 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
GOLGA6BA6NDN3 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
GOLGA6BA6NDN3 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
GOLGA6BA6NDN3 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
GOLGA6BA6NDN3 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
GOLGA6BA6NDN3 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
GOLGA6BA6NDN3 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
GOLGA6BA6NDN3 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
GOLGA6BA6NDN3 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
GOLGA6BA6NDN3 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
GOLGA6BA6NDN3 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
GOLGA6BA6NDN3 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
GOLGA6BA6NDN3 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
GOLGA6BA6NDN3 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
GOLGA6BA6NDN3 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
GOLGA6BA6NDN3 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
GOLGA6BA6NDN3 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
GOLGA6BA6NDN3 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
GOLGA6BA6NDN3 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
GOLGA6BA6NDN3 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
GOLGA6BA6NDN3 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
GOLGA6BA6NDN3 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
GOLGA6BA6NDN3 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
GOLGA6BA6NDN3 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
GOLGA6BA6NDN3 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
GOLGA6BA6NDN3 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
GOLGA6BA6NDN3 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
GOLGA6BA6NDN3 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
GOLGA6BA6NDN3 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
GOLGA6BA6NDN3 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
GOLGA6BA6NDN3 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
GOLGA6BA6NDN3 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
GOLGA6BA6NDN3 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
GOLGA6BA6NDN3 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
GOLGA6BA6NDN3 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
GOLGA6BA6NDN3 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
GOLGA6BA6NDN3 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
GOLGA6BA6NDN3 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
GOLGA6BA6NDN3 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
GOLGA6BA6NDN3 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
GOLGA6BA6NDN3 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
GOLGA6BA6NDN3 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
GOLGA6BA6NDN3 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
GOLGA6BA6NDN3 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
GOLGA6BA6NDN3 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
GOLGA6BA6NDN3 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
GOLGA6BA6NDN3 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
GOLGA6BA6NDN3 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
GOLGA6BA6NDN3 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
GOLGA6BA6NDN3 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
GOLGA6BA6NDN3 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
GOLGA6BA6NDN3 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
GOLGA6BA6NDN3 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
GOLGA6BA6NDN3 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
GOLGA6BA6NDN3 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
GOLGA6BA6NDN3 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
GOLGA6BA6NDN3 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
GOLGA6BA6NDN3 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
GOLGA6BA6NDN3 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
GOLGA6BA6NDN3 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
GOLGA6BA6NDN3 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
GOLGA6BA6NDN3 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
GOLGA6BA6NDN3 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
GOLGA6BA6NDN3 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
GOLGA6BA6NDN3 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
GOLGA6BA6NDN3 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
GOLGA6BA6NDN3 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
GOLGA6BA6NDN3 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
GOLGA6BA6NDN3 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
GOLGA6BA6NDN3 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
GOLGA6BA6NDN3 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
GOLGA6BA6NDN3 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
GOLGA6BA6NDN3 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
GOLGA6BA6NDN3 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
GOLGA6BA6NDN3 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
GOLGA6BA6NDN3 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
GOLGA6BA6NDN3 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
GOLGA6BA6NDN3 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
GOLGA6BA6NDN3 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
GOLGA6BA6NDN3 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
GOLGA6BA6NDN3 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
GOLGA6BA6NDN3 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
GOLGA6BA6NDN3 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
GOLGA6BA6NDN3 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
GOLGA6BA6NDN3 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
GOLGA6BA6NDN3 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
GOLGA6BA6NDN3 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
GOLGA6BA6NDN3 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
GOLGA6BA6NDN3 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
GOLGA6BA6NDN3 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
GOLGA6BA6NDN3 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
GOLGA6BA6NDN3 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
GOLGA6BA6NDN3 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
GOLGA6BA6NDN3 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
GOLGA6BA6NDN3 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
GOLGA6BA6NDN3 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
GOLGA6BA6NDN3 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms