Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEY7

USP33, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 33, humanhuman

Predictions only

Length 942 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP33Q8TEY7 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP33Q8TEY7 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP33Q8TEY7 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP33Q8TEY7 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP33Q8TEY7 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP33Q8TEY7 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
USP33Q8TEY7 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
USP33Q8TEY7 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
USP33Q8TEY7 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
USP33Q8TEY7 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
USP33Q8TEY7 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
USP33Q8TEY7 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
USP33Q8TEY7 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
USP33Q8TEY7 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP33Q8TEY7 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP33Q8TEY7 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP33Q8TEY7 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP33Q8TEY7 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP33Q8TEY7 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP33Q8TEY7 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP33Q8TEY7 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP33Q8TEY7 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
USP33Q8TEY7 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP33Q8TEY7 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP33Q8TEY7 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP33Q8TEY7 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP33Q8TEY7 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP33Q8TEY7 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP33Q8TEY7 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP33Q8TEY7 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP33Q8TEY7 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP33Q8TEY7 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP33Q8TEY7 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP33Q8TEY7 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP33Q8TEY7 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP33Q8TEY7 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP33Q8TEY7 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP33Q8TEY7 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP33Q8TEY7 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP33Q8TEY7 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP33Q8TEY7 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
USP33Q8TEY7 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
USP33Q8TEY7 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP33Q8TEY7 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
USP33Q8TEY7 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP33Q8TEY7 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP33Q8TEY7 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP33Q8TEY7 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP33Q8TEY7 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP33Q8TEY7 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
USP33Q8TEY7 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
USP33Q8TEY7 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP33Q8TEY7 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP33Q8TEY7 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP33Q8TEY7 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP33Q8TEY7 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
USP33Q8TEY7 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP33Q8TEY7 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP33Q8TEY7 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP33Q8TEY7 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP33Q8TEY7 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP33Q8TEY7 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP33Q8TEY7 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP33Q8TEY7 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP33Q8TEY7 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP33Q8TEY7 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP33Q8TEY7 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP33Q8TEY7 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
USP33Q8TEY7 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
USP33Q8TEY7 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
USP33Q8TEY7 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
USP33Q8TEY7 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
USP33Q8TEY7 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
USP33Q8TEY7 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
USP33Q8TEY7 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
USP33Q8TEY7 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
USP33Q8TEY7 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
USP33Q8TEY7 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
USP33Q8TEY7 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
USP33Q8TEY7 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP33Q8TEY7 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP33Q8TEY7 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP33Q8TEY7 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP33Q8TEY7 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP33Q8TEY7 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP33Q8TEY7 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP33Q8TEY7 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
USP33Q8TEY7 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP33Q8TEY7 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP33Q8TEY7 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP33Q8TEY7 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP33Q8TEY7 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP33Q8TEY7 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP33Q8TEY7 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP33Q8TEY7 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP33Q8TEY7 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP33Q8TEY7 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP33Q8TEY7 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP33Q8TEY7 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP33Q8TEY7 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms