Protein–RNA interactions for Protein: Q13487

SNAPC2, snRNA-activating protein complex subunit 2, humanhuman

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Length 334 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC2Q13487 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SNAPC2Q13487 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SNAPC2Q13487 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SNAPC2Q13487 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SNAPC2Q13487 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SNAPC2Q13487 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
SNAPC2Q13487 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SNAPC2Q13487 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SNAPC2Q13487 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SNAPC2Q13487 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SNAPC2Q13487 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SNAPC2Q13487 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SNAPC2Q13487 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SNAPC2Q13487 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
SNAPC2Q13487 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SNAPC2Q13487 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SNAPC2Q13487 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SNAPC2Q13487 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SNAPC2Q13487 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
SNAPC2Q13487 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SNAPC2Q13487 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
SNAPC2Q13487 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SNAPC2Q13487 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SNAPC2Q13487 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SNAPC2Q13487 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SNAPC2Q13487 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SNAPC2Q13487 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SNAPC2Q13487 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SNAPC2Q13487 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SNAPC2Q13487 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SNAPC2Q13487 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SNAPC2Q13487 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
SNAPC2Q13487 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SNAPC2Q13487 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SNAPC2Q13487 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SNAPC2Q13487 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SNAPC2Q13487 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SNAPC2Q13487 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SNAPC2Q13487 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SNAPC2Q13487 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SNAPC2Q13487 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SNAPC2Q13487 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SNAPC2Q13487 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SNAPC2Q13487 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SNAPC2Q13487 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SNAPC2Q13487 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SNAPC2Q13487 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SNAPC2Q13487 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SNAPC2Q13487 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SNAPC2Q13487 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SNAPC2Q13487 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SNAPC2Q13487 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SNAPC2Q13487 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SNAPC2Q13487 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SNAPC2Q13487 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SNAPC2Q13487 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SNAPC2Q13487 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SNAPC2Q13487 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
SNAPC2Q13487 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
SNAPC2Q13487 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
SNAPC2Q13487 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
SNAPC2Q13487 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SNAPC2Q13487 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SNAPC2Q13487 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SNAPC2Q13487 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SNAPC2Q13487 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SNAPC2Q13487 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SNAPC2Q13487 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SNAPC2Q13487 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SNAPC2Q13487 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SNAPC2Q13487 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SNAPC2Q13487 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
SNAPC2Q13487 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SNAPC2Q13487 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SNAPC2Q13487 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SNAPC2Q13487 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SNAPC2Q13487 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SNAPC2Q13487 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SNAPC2Q13487 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SNAPC2Q13487 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SNAPC2Q13487 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SNAPC2Q13487 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SNAPC2Q13487 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SNAPC2Q13487 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SNAPC2Q13487 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SNAPC2Q13487 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SNAPC2Q13487 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SNAPC2Q13487 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SNAPC2Q13487 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SNAPC2Q13487 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SNAPC2Q13487 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SNAPC2Q13487 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SNAPC2Q13487 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
SNAPC2Q13487 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SNAPC2Q13487 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SNAPC2Q13487 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SNAPC2Q13487 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SNAPC2Q13487 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SNAPC2Q13487 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SNAPC2Q13487 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
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