RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000445427.1

PRKCQ-AS1-202, PRKCQ antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PRKCQ-AS1, Length 1,133 nt, Biotype lincRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 NISCHQ9Y2I1 1504 aa52.8■■■■■ 6.04
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa47.08■■■■■ 5.13
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 ABCC9O60706 1549 aa46.19■■■■■ 4.99
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa44.4■■■■■ 4.7
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 NACADO15069 1562 aa44.3■■■■■ 4.68
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 DCAF8L2P0C7V8 631 aa44.19■■■■■ 4.66
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 MYO15BQ96JP2 1530 aa43.95■■■■■ 4.63
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP43.95■■■■■ 4.63
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa43.69■■■■■ 4.59
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 UNC13AQ9UPW8 1703 aa43.39■■■■■ 4.54
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP43.1■■■■■ 4.49
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 BICRAQ9NZM4 1560 aa43.01■■■■■ 4.48
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 SCRIBQ14160 1630 aa42.91■■■■■ 4.46
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa42.6■■■■■ 4.41
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 DNAJC5BQ9UF47 199 aa42.49■■■■■ 4.39
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP41.92■■■■■ 4.3
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa41.8■■■■■ 4.28
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 CECR2Q9BXF3 1484 aa41.54■■■■■ 4.24
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 SMARCA4P51532 1647 aa41.04■■■■■ 4.16
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP40.97■■■■■ 4.15
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 NCAPD3P42695 1498 aa40.83■■■■■ 4.13
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa40.83■■■■■ 4.13
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 SMARCA2P51531 1590 aa40.82■■■■■ 4.12
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 MROH2BQ7Z745 1585 aa40.67■■■■■ 4.1
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 HMGXB3Q12766 1538 aa40.66■■■■■ 4.1
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 PEG3Q9GZU2 1588 aa40.62■■■■■ 4.09
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP40.51■■■■■ 4.08
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 WIZO95785 1651 aa40.24■■■■■ 4.03
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP40.13■■■■■ 4.01
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 NESP48681 1621 aa39.91■■■■□ 3.98
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 ERCC6Q03468 1493 aa39.88■■■■□ 3.98
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa39.84■■■■□ 3.97
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP39.82■■■■□ 3.97
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 CADPSQ9ULU8 1353 aa39.64■■■■□ 3.94
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 PDS5BQ9NTI5 1447 aa39.57■■■■□ 3.92
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 CUX2O14529 1486 aa39.51■■■■□ 3.92
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa39.48■■■■□ 3.91
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP39.38■■■■□ 3.89
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 CFTRP13569 1480 aa39.37■■■■□ 3.89
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 CCDC88BA6NC98 1476 aa39.32■■■■□ 3.89
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 FANCD2Q9BXW9 1451 aa39.2■■■■□ 3.87
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 CEP164Q9UPV0 1460 aa39.19■■■■□ 3.86
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 MRC2Q9UBG0 1479 aa39.17■■■■□ 3.86
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 PRDM2Q13029 1718 aa39.14■■■■□ 3.86
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 WDR62O43379 1518 aa39.04■■■■□ 3.84
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP38.98■■■■□ 3.83
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP38.8■■■■□ 3.8
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 ABCC8Q09428 1581 aa38.57■■■■□ 3.76
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 TOPBP1Q92547 1522 aa38.55■■■■□ 3.76
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 DNMBPQ6XZF7 1577 aa38.51■■■■□ 3.76
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa38.48■■■■□ 3.75
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 IFT140Q96RY7 1462 aa38.36■■■■□ 3.73
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP38.21■■■■□ 3.71
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 CUX1P39880 1505 aa38.17■■■■□ 3.7
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP38.17■■■■□ 3.7
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP38.14■■■■□ 3.7
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 FGD5Q6ZNL6 1462 aa38.09■■■■□ 3.69
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP38.06■■■■□ 3.68
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 SOGA1O94964 1423 aa38.04■■■■□ 3.68
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa38.03■■■■□ 3.68
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP37.94■■■■□ 3.667e-7■□□□□ 9
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 WDR97A6NE52 1622 aa37.88■■■■□ 3.65
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP37.87■■■■□ 3.65
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP37.83■■■■□ 3.65
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 TOP2BQ02880 1626 aa37.83■■■■□ 3.65
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa37.83■■■■□ 3.65
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 OSCARQ8IYS5 282 aa37.82■■■■□ 3.64
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 SYNJ1O43426 1573 aa37.78■■■■□ 3.64
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa37.71■■■■□ 3.63
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 GRIN2BQ13224 1484 aa37.64■■■■□ 3.62
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 CHD1O14646 1710 aa37.64■■■■□ 3.62
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 GAPVD1Q14C86 1478 aa37.62■■■■□ 3.61
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa37.6■■■■□ 3.61
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa37.59■■■■□ 3.61
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 PBRM1Q86U86 1689 aa37.59■■■■□ 3.61
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP37.58■■■■□ 3.61
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 FBLN2P98095 1184 aa37.55■■■■□ 3.6
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 SYNJ2O15056 1496 aa37.42■■■■□ 3.58
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP37.42■■■■□ 3.58
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 ERICH3Q5RHP9 1530 aa37.28■■■■□ 3.56
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 ADAMTS12P58397 1594 aa37.25■■■■□ 3.55
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa37.25■■■■□ 3.55
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa37.25■■■■□ 3.55
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa37.25■■■■□ 3.55
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 ARHGEF11O15085 1522 aa37.22■■■■□ 3.55
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 CLASP1Q7Z460 1538 aa37.19■■■■□ 3.54
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 FHAD1B1AJZ9 1412 aa37.18■■■■□ 3.54
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 TRIM41Q8WV44 630 aa37.16■■■■□ 3.54
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 GRIN2AQ12879 1464 aa37.15■■■■□ 3.54
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 KIF27Q86VH2 1401 aa37.11■■■■□ 3.53
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 NUP160Q12769 1436 aa36.98■■■■□ 3.51
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 CEP170Q5SW79 1584 aa36.97■■■■□ 3.51
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 IGF1RP08069 1367 aa36.93■■■■□ 3.5
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 CUL7Q14999 1698 aa36.93■■■■□ 3.5
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 ARAP1Q96P48 1450 aa36.89■■■■□ 3.5
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 CYB5RLQ6IPT4 315 aa36.86■■■■□ 3.49
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa36.75■■■■□ 3.47
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 SHROOM2Q13796 1616 aa36.74■■■■□ 3.47
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa36.7■■■■□ 3.47
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 ERCC6L2Q5T890 1561 aa36.63■■■■□ 3.45
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