Protein–RNA interactions for Protein: Q05086

UBE3A, Ubiquitin-protein ligase E3A, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3AQ05086 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
UBE3AQ05086 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
UBE3AQ05086 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
UBE3AQ05086 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
UBE3AQ05086 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
UBE3AQ05086 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
UBE3AQ05086 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
UBE3AQ05086 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
UBE3AQ05086 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
UBE3AQ05086 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
UBE3AQ05086 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
UBE3AQ05086 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
UBE3AQ05086 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
UBE3AQ05086 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
UBE3AQ05086 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
UBE3AQ05086 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
UBE3AQ05086 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
UBE3AQ05086 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
UBE3AQ05086 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
UBE3AQ05086 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
UBE3AQ05086 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24■■□□□ 1.43
UBE3AQ05086 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
UBE3AQ05086 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
UBE3AQ05086 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
UBE3AQ05086 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
UBE3AQ05086 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
UBE3AQ05086 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
UBE3AQ05086 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
UBE3AQ05086 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBE3AQ05086 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBE3AQ05086 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBE3AQ05086 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBE3AQ05086 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
UBE3AQ05086 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBE3AQ05086 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
UBE3AQ05086 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
UBE3AQ05086 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
UBE3AQ05086 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
UBE3AQ05086 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
UBE3AQ05086 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
UBE3AQ05086 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
UBE3AQ05086 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
UBE3AQ05086 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
UBE3AQ05086 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
UBE3AQ05086 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
UBE3AQ05086 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
UBE3AQ05086 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
UBE3AQ05086 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
UBE3AQ05086 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
UBE3AQ05086 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
UBE3AQ05086 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
UBE3AQ05086 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
UBE3AQ05086 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
UBE3AQ05086 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBE3AQ05086 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBE3AQ05086 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBE3AQ05086 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBE3AQ05086 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBE3AQ05086 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBE3AQ05086 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBE3AQ05086 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBE3AQ05086 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
UBE3AQ05086 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
UBE3AQ05086 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
UBE3AQ05086 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
UBE3AQ05086 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
UBE3AQ05086 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
UBE3AQ05086 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
UBE3AQ05086 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
UBE3AQ05086 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
UBE3AQ05086 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
UBE3AQ05086 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
UBE3AQ05086 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
UBE3AQ05086 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
UBE3AQ05086 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
UBE3AQ05086 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
UBE3AQ05086 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
UBE3AQ05086 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
UBE3AQ05086 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
UBE3AQ05086 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
UBE3AQ05086 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
UBE3AQ05086 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
UBE3AQ05086 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
UBE3AQ05086 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
UBE3AQ05086 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
UBE3AQ05086 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
UBE3AQ05086 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
UBE3AQ05086 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
UBE3AQ05086 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
UBE3AQ05086 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
UBE3AQ05086 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
UBE3AQ05086 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
UBE3AQ05086 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
UBE3AQ05086 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
UBE3AQ05086 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
UBE3AQ05086 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
UBE3AQ05086 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
UBE3AQ05086 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
UBE3AQ05086 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
UBE3AQ05086 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms