Protein–RNA interactions for Protein: P42898

MTHFR, Methylenetetrahydrofolate reductase, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTHFRP42898 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MTHFRP42898 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
MTHFRP42898 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MTHFRP42898 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MTHFRP42898 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
MTHFRP42898 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MTHFRP42898 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MTHFRP42898 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MTHFRP42898 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MTHFRP42898 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MTHFRP42898 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MTHFRP42898 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MTHFRP42898 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
MTHFRP42898 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
MTHFRP42898 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
MTHFRP42898 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
MTHFRP42898 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MTHFRP42898 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MTHFRP42898 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MTHFRP42898 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MTHFRP42898 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MTHFRP42898 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
MTHFRP42898 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MTHFRP42898 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MTHFRP42898 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MTHFRP42898 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MTHFRP42898 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MTHFRP42898 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MTHFRP42898 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MTHFRP42898 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MTHFRP42898 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MTHFRP42898 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MTHFRP42898 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MTHFRP42898 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MTHFRP42898 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MTHFRP42898 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MTHFRP42898 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MTHFRP42898 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MTHFRP42898 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MTHFRP42898 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MTHFRP42898 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MTHFRP42898 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MTHFRP42898 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MTHFRP42898 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MTHFRP42898 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MTHFRP42898 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MTHFRP42898 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MTHFRP42898 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MTHFRP42898 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MTHFRP42898 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
MTHFRP42898 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MTHFRP42898 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MTHFRP42898 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
MTHFRP42898 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MTHFRP42898 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MTHFRP42898 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MTHFRP42898 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MTHFRP42898 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MTHFRP42898 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MTHFRP42898 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MTHFRP42898 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MTHFRP42898 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MTHFRP42898 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MTHFRP42898 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MTHFRP42898 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MTHFRP42898 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
MTHFRP42898 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MTHFRP42898 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MTHFRP42898 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MTHFRP42898 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MTHFRP42898 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MTHFRP42898 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MTHFRP42898 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MTHFRP42898 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MTHFRP42898 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MTHFRP42898 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MTHFRP42898 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MTHFRP42898 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MTHFRP42898 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MTHFRP42898 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MTHFRP42898 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MTHFRP42898 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MTHFRP42898 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MTHFRP42898 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MTHFRP42898 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MTHFRP42898 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MTHFRP42898 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MTHFRP42898 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MTHFRP42898 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MTHFRP42898 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MTHFRP42898 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
MTHFRP42898 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MTHFRP42898 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
MTHFRP42898 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MTHFRP42898 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MTHFRP42898 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MTHFRP42898 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MTHFRP42898 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MTHFRP42898 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MTHFRP42898 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms