Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L5

TRAPPC8, Trafficking protein particle complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8Q9Y2L5 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
TRAPPC8Q9Y2L5 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC34.4■■■■□ 3.1
TRAPPC8Q9Y2L5 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
TRAPPC8Q9Y2L5 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
TRAPPC8Q9Y2L5 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
TRAPPC8Q9Y2L5 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
TRAPPC8Q9Y2L5 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
TRAPPC8Q9Y2L5 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
TRAPPC8Q9Y2L5 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
TRAPPC8Q9Y2L5 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
TRAPPC8Q9Y2L5 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
TRAPPC8Q9Y2L5 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
TRAPPC8Q9Y2L5 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
TRAPPC8Q9Y2L5 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
TRAPPC8Q9Y2L5 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
TRAPPC8Q9Y2L5 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
TRAPPC8Q9Y2L5 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
TRAPPC8Q9Y2L5 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
TRAPPC8Q9Y2L5 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
TRAPPC8Q9Y2L5 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC34.37■■■■□ 3.09
TRAPPC8Q9Y2L5 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
TRAPPC8Q9Y2L5 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
TRAPPC8Q9Y2L5 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
TRAPPC8Q9Y2L5 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
TRAPPC8Q9Y2L5 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC34.36■■■■□ 3.09
TRAPPC8Q9Y2L5 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
TRAPPC8Q9Y2L5 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
TRAPPC8Q9Y2L5 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC34.35■■■■□ 3.09
TRAPPC8Q9Y2L5 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
TRAPPC8Q9Y2L5 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
TRAPPC8Q9Y2L5 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
TRAPPC8Q9Y2L5 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC34.35■■■■□ 3.09
TRAPPC8Q9Y2L5 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC34.35■■■■□ 3.09
TRAPPC8Q9Y2L5 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
TRAPPC8Q9Y2L5 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC34.35■■■■□ 3.09
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
TRAPPC8Q9Y2L5 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
TRAPPC8Q9Y2L5 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
TRAPPC8Q9Y2L5 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
TRAPPC8Q9Y2L5 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
TRAPPC8Q9Y2L5 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
TRAPPC8Q9Y2L5 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
TRAPPC8Q9Y2L5 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC34.33■■■■□ 3.09
TRAPPC8Q9Y2L5 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
TRAPPC8Q9Y2L5 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
TRAPPC8Q9Y2L5 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC34.33■■■■□ 3.09
TRAPPC8Q9Y2L5 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC34.33■■■■□ 3.09
TRAPPC8Q9Y2L5 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
TRAPPC8Q9Y2L5 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC34.32■■■■□ 3.08
TRAPPC8Q9Y2L5 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
TRAPPC8Q9Y2L5 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
TRAPPC8Q9Y2L5 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
TRAPPC8Q9Y2L5 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
TRAPPC8Q9Y2L5 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
TRAPPC8Q9Y2L5 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC34.31■■■■□ 3.08
TRAPPC8Q9Y2L5 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
TRAPPC8Q9Y2L5 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
TRAPPC8Q9Y2L5 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
TRAPPC8Q9Y2L5 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
TRAPPC8Q9Y2L5 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC34.3■■■■□ 3.08
TRAPPC8Q9Y2L5 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
TRAPPC8Q9Y2L5 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
TRAPPC8Q9Y2L5 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
TRAPPC8Q9Y2L5 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
TRAPPC8Q9Y2L5 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC34.29■■■■□ 3.08
TRAPPC8Q9Y2L5 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
TRAPPC8Q9Y2L5 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
TRAPPC8Q9Y2L5 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
TRAPPC8Q9Y2L5 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
TRAPPC8Q9Y2L5 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
TRAPPC8Q9Y2L5 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
TRAPPC8Q9Y2L5 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
TRAPPC8Q9Y2L5 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC34.28■■■■□ 3.08
TRAPPC8Q9Y2L5 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC34.28■■■■□ 3.08
TRAPPC8Q9Y2L5 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC34.28■■■■□ 3.08
TRAPPC8Q9Y2L5 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC34.28■■■■□ 3.08
TRAPPC8Q9Y2L5 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
TRAPPC8Q9Y2L5 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC34.28■■■■□ 3.08
TRAPPC8Q9Y2L5 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
TRAPPC8Q9Y2L5 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
TRAPPC8Q9Y2L5 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC34.27■■■■□ 3.08
TRAPPC8Q9Y2L5 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
TRAPPC8Q9Y2L5 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
TRAPPC8Q9Y2L5 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
TRAPPC8Q9Y2L5 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
TRAPPC8Q9Y2L5 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
TRAPPC8Q9Y2L5 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
TRAPPC8Q9Y2L5 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC34.26■■■■□ 3.08
TRAPPC8Q9Y2L5 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC34.26■■■■□ 3.07
TRAPPC8Q9Y2L5 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.07
TRAPPC8Q9Y2L5 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.07
TRAPPC8Q9Y2L5 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
TRAPPC8Q9Y2L5 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.07
TRAPPC8Q9Y2L5 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
TRAPPC8Q9Y2L5 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC34.25■■■■□ 3.07
TRAPPC8Q9Y2L5 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC34.25■■■■□ 3.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 138.2 ms