Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SRSF5Q13243 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SRSF5Q13243 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SRSF5Q13243 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SRSF5Q13243 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SRSF5Q13243 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SRSF5Q13243 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SRSF5Q13243 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SRSF5Q13243 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SRSF5Q13243 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SRSF5Q13243 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SRSF5Q13243 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SRSF5Q13243 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SRSF5Q13243 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SRSF5Q13243 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SRSF5Q13243 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SRSF5Q13243 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SRSF5Q13243 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SRSF5Q13243 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SRSF5Q13243 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SRSF5Q13243 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SRSF5Q13243 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SRSF5Q13243 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SRSF5Q13243 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SRSF5Q13243 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SRSF5Q13243 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SRSF5Q13243 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SRSF5Q13243 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SRSF5Q13243 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SRSF5Q13243 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SRSF5Q13243 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SRSF5Q13243 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SRSF5Q13243 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SRSF5Q13243 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SRSF5Q13243 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SRSF5Q13243 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SRSF5Q13243 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SRSF5Q13243 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SRSF5Q13243 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SRSF5Q13243 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
SRSF5Q13243 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SRSF5Q13243 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SRSF5Q13243 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SRSF5Q13243 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SRSF5Q13243 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SRSF5Q13243 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SRSF5Q13243 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SRSF5Q13243 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SRSF5Q13243 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SRSF5Q13243 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SRSF5Q13243 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SRSF5Q13243 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SRSF5Q13243 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SRSF5Q13243 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SRSF5Q13243 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SRSF5Q13243 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SRSF5Q13243 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SRSF5Q13243 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SRSF5Q13243 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SRSF5Q13243 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SRSF5Q13243 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SRSF5Q13243 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SRSF5Q13243 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SRSF5Q13243 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SRSF5Q13243 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SRSF5Q13243 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SRSF5Q13243 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SRSF5Q13243 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SRSF5Q13243 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SRSF5Q13243 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SRSF5Q13243 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SRSF5Q13243 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SRSF5Q13243 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SRSF5Q13243 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SRSF5Q13243 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SRSF5Q13243 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SRSF5Q13243 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SRSF5Q13243 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SRSF5Q13243 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SRSF5Q13243 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SRSF5Q13243 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SRSF5Q13243 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SRSF5Q13243 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SRSF5Q13243 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SRSF5Q13243 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SRSF5Q13243 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SRSF5Q13243 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SRSF5Q13243 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SRSF5Q13243 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SRSF5Q13243 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SRSF5Q13243 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SRSF5Q13243 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SRSF5Q13243 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SRSF5Q13243 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SRSF5Q13243 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SRSF5Q13243 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SRSF5Q13243 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SRSF5Q13243 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SRSF5Q13243 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SRSF5Q13243 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
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