Protein–RNA interactions for Protein: Q15572

TAF1C, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1CQ15572 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TAF1CQ15572 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TAF1CQ15572 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TAF1CQ15572 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TAF1CQ15572 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TAF1CQ15572 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
TAF1CQ15572 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TAF1CQ15572 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TAF1CQ15572 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TAF1CQ15572 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TAF1CQ15572 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TAF1CQ15572 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TAF1CQ15572 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TAF1CQ15572 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TAF1CQ15572 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TAF1CQ15572 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TAF1CQ15572 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
TAF1CQ15572 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
TAF1CQ15572 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TAF1CQ15572 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TAF1CQ15572 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TAF1CQ15572 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TAF1CQ15572 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TAF1CQ15572 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TAF1CQ15572 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TAF1CQ15572 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
TAF1CQ15572 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TAF1CQ15572 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TAF1CQ15572 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TAF1CQ15572 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TAF1CQ15572 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TAF1CQ15572 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
TAF1CQ15572 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TAF1CQ15572 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TAF1CQ15572 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TAF1CQ15572 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TAF1CQ15572 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TAF1CQ15572 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TAF1CQ15572 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TAF1CQ15572 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TAF1CQ15572 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TAF1CQ15572 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TAF1CQ15572 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TAF1CQ15572 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TAF1CQ15572 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TAF1CQ15572 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TAF1CQ15572 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TAF1CQ15572 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TAF1CQ15572 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TAF1CQ15572 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TAF1CQ15572 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TAF1CQ15572 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TAF1CQ15572 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TAF1CQ15572 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
TAF1CQ15572 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TAF1CQ15572 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TAF1CQ15572 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TAF1CQ15572 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TAF1CQ15572 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TAF1CQ15572 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TAF1CQ15572 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
TAF1CQ15572 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TAF1CQ15572 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TAF1CQ15572 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TAF1CQ15572 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TAF1CQ15572 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TAF1CQ15572 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TAF1CQ15572 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TAF1CQ15572 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TAF1CQ15572 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TAF1CQ15572 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TAF1CQ15572 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TAF1CQ15572 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TAF1CQ15572 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TAF1CQ15572 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TAF1CQ15572 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TAF1CQ15572 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TAF1CQ15572 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TAF1CQ15572 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TAF1CQ15572 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TAF1CQ15572 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TAF1CQ15572 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TAF1CQ15572 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TAF1CQ15572 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TAF1CQ15572 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TAF1CQ15572 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TAF1CQ15572 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TAF1CQ15572 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TAF1CQ15572 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
TAF1CQ15572 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TAF1CQ15572 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TAF1CQ15572 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TAF1CQ15572 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TAF1CQ15572 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TAF1CQ15572 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TAF1CQ15572 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TAF1CQ15572 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TAF1CQ15572 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TAF1CQ15572 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TAF1CQ15572 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
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