Protein–RNA interactions for Protein: P31267

HOXA6, Homeobox protein Hox-A6, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA6P31267 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXA6P31267 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXA6P31267 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXA6P31267 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXA6P31267 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXA6P31267 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXA6P31267 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXA6P31267 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXA6P31267 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXA6P31267 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXA6P31267 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXA6P31267 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXA6P31267 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXA6P31267 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXA6P31267 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXA6P31267 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXA6P31267 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXA6P31267 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXA6P31267 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXA6P31267 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXA6P31267 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXA6P31267 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXA6P31267 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXA6P31267 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXA6P31267 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXA6P31267 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXA6P31267 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXA6P31267 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXA6P31267 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXA6P31267 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXA6P31267 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXA6P31267 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXA6P31267 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXA6P31267 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXA6P31267 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXA6P31267 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXA6P31267 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXA6P31267 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXA6P31267 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXA6P31267 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXA6P31267 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXA6P31267 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXA6P31267 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXA6P31267 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXA6P31267 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXA6P31267 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXA6P31267 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXA6P31267 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXA6P31267 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXA6P31267 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXA6P31267 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXA6P31267 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXA6P31267 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXA6P31267 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXA6P31267 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXA6P31267 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXA6P31267 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXA6P31267 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXA6P31267 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXA6P31267 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXA6P31267 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXA6P31267 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXA6P31267 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXA6P31267 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXA6P31267 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXA6P31267 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXA6P31267 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXA6P31267 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXA6P31267 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXA6P31267 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXA6P31267 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXA6P31267 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXA6P31267 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXA6P31267 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXA6P31267 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXA6P31267 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXA6P31267 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXA6P31267 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXA6P31267 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXA6P31267 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXA6P31267 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXA6P31267 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXA6P31267 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXA6P31267 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXA6P31267 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXA6P31267 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXA6P31267 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXA6P31267 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXA6P31267 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXA6P31267 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXA6P31267 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXA6P31267 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXA6P31267 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXA6P31267 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXA6P31267 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXA6P31267 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXA6P31267 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXA6P31267 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXA6P31267 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXA6P31267 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms