Protein–RNA interactions for Protein: P31267

HOXA6, Homeobox protein Hox-A6, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA6P31267 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC34.91■■■■□ 3.18
HOXA6P31267 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC34.83■■■■□ 3.17
HOXA6P31267 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.32■■■■□ 3.08
HOXA6P31267 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
HOXA6P31267 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
HOXA6P31267 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
HOXA6P31267 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
HOXA6P31267 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
HOXA6P31267 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC33.14■■■□□ 2.9
HOXA6P31267 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC33.11■■■□□ 2.89
HOXA6P31267 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
HOXA6P31267 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
HOXA6P31267 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC32.87■■■□□ 2.85
HOXA6P31267 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
HOXA6P31267 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
HOXA6P31267 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
HOXA6P31267 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.8
HOXA6P31267 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
HOXA6P31267 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
HOXA6P31267 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
HOXA6P31267 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
HOXA6P31267 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
HOXA6P31267 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC32.12■■■□□ 2.73
HOXA6P31267 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
HOXA6P31267 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
HOXA6P31267 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
HOXA6P31267 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.93■■■□□ 2.7
HOXA6P31267 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC31.9■■■□□ 2.7
HOXA6P31267 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC31.87■■■□□ 2.69
HOXA6P31267 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC31.76■■■□□ 2.67
HOXA6P31267 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC31.73■■■□□ 2.67
HOXA6P31267 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
HOXA6P31267 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
HOXA6P31267 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC31.58■■■□□ 2.65
HOXA6P31267 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
HOXA6P31267 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC31.46■■■□□ 2.63
HOXA6P31267 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
HOXA6P31267 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
HOXA6P31267 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
HOXA6P31267 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
HOXA6P31267 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
HOXA6P31267 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
HOXA6P31267 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
HOXA6P31267 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
HOXA6P31267 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
HOXA6P31267 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
HOXA6P31267 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
HOXA6P31267 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
HOXA6P31267 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
HOXA6P31267 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
HOXA6P31267 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
HOXA6P31267 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
HOXA6P31267 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
HOXA6P31267 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC30.6■■■□□ 2.49
HOXA6P31267 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
HOXA6P31267 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
HOXA6P31267 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
HOXA6P31267 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
HOXA6P31267 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
HOXA6P31267 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC30.47■■■□□ 2.47
HOXA6P31267 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
HOXA6P31267 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
HOXA6P31267 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC30.44■■■□□ 2.46
HOXA6P31267 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
HOXA6P31267 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
HOXA6P31267 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
HOXA6P31267 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
HOXA6P31267 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
HOXA6P31267 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
HOXA6P31267 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.23■■■□□ 2.43
HOXA6P31267 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
HOXA6P31267 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
HOXA6P31267 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
HOXA6P31267 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
HOXA6P31267 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
HOXA6P31267 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
HOXA6P31267 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
HOXA6P31267 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
HOXA6P31267 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
HOXA6P31267 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
HOXA6P31267 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC30.03■■■□□ 2.4
HOXA6P31267 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
HOXA6P31267 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC30■■■□□ 2.39
HOXA6P31267 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
HOXA6P31267 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
HOXA6P31267 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
HOXA6P31267 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
HOXA6P31267 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
HOXA6P31267 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
HOXA6P31267 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
HOXA6P31267 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
HOXA6P31267 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
HOXA6P31267 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
HOXA6P31267 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
HOXA6P31267 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
HOXA6P31267 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
HOXA6P31267 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
HOXA6P31267 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
HOXA6P31267 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
HOXA6P31267 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 125.5 ms