Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQR7

CCDC177, Coiled-coil domain-containing protein 177, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC177Q9NQR7 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC177Q9NQR7 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC177Q9NQR7 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC177Q9NQR7 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC177Q9NQR7 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC177Q9NQR7 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC177Q9NQR7 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC177Q9NQR7 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC177Q9NQR7 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC177Q9NQR7 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC177Q9NQR7 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC177Q9NQR7 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC177Q9NQR7 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC177Q9NQR7 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC177Q9NQR7 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC177Q9NQR7 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC177Q9NQR7 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC177Q9NQR7 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC177Q9NQR7 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC177Q9NQR7 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC177Q9NQR7 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC177Q9NQR7 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC177Q9NQR7 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC177Q9NQR7 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC177Q9NQR7 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC177Q9NQR7 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC177Q9NQR7 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC177Q9NQR7 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC177Q9NQR7 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC177Q9NQR7 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC177Q9NQR7 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC177Q9NQR7 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC177Q9NQR7 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC177Q9NQR7 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC177Q9NQR7 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC177Q9NQR7 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC177Q9NQR7 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC177Q9NQR7 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC177Q9NQR7 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC177Q9NQR7 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC177Q9NQR7 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC177Q9NQR7 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC177Q9NQR7 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC177Q9NQR7 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC177Q9NQR7 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC177Q9NQR7 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC177Q9NQR7 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC177Q9NQR7 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC177Q9NQR7 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC177Q9NQR7 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC177Q9NQR7 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC177Q9NQR7 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC177Q9NQR7 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC177Q9NQR7 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC177Q9NQR7 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC177Q9NQR7 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC177Q9NQR7 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC177Q9NQR7 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC177Q9NQR7 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC177Q9NQR7 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC177Q9NQR7 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC177Q9NQR7 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC177Q9NQR7 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC177Q9NQR7 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC177Q9NQR7 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC177Q9NQR7 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC177Q9NQR7 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC177Q9NQR7 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC177Q9NQR7 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC177Q9NQR7 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC177Q9NQR7 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC177Q9NQR7 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC177Q9NQR7 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC177Q9NQR7 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC177Q9NQR7 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC177Q9NQR7 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC177Q9NQR7 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC177Q9NQR7 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC177Q9NQR7 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC177Q9NQR7 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC177Q9NQR7 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC177Q9NQR7 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC177Q9NQR7 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC177Q9NQR7 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC177Q9NQR7 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC177Q9NQR7 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC177Q9NQR7 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC177Q9NQR7 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC177Q9NQR7 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC177Q9NQR7 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC177Q9NQR7 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC177Q9NQR7 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC177Q9NQR7 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC177Q9NQR7 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC177Q9NQR7 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC177Q9NQR7 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC177Q9NQR7 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC177Q9NQR7 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC177Q9NQR7 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC177Q9NQR7 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms