Protein–RNA interactions for Protein: Q8NAE3

LINC01555, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01555, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01555Q8NAE3 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LINC01555Q8NAE3 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LINC01555Q8NAE3 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LINC01555Q8NAE3 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LINC01555Q8NAE3 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LINC01555Q8NAE3 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LINC01555Q8NAE3 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LINC01555Q8NAE3 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LINC01555Q8NAE3 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LINC01555Q8NAE3 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LINC01555Q8NAE3 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LINC01555Q8NAE3 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LINC01555Q8NAE3 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LINC01555Q8NAE3 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LINC01555Q8NAE3 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
LINC01555Q8NAE3 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
LINC01555Q8NAE3 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
LINC01555Q8NAE3 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
LINC01555Q8NAE3 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LINC01555Q8NAE3 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LINC01555Q8NAE3 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LINC01555Q8NAE3 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LINC01555Q8NAE3 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LINC01555Q8NAE3 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LINC01555Q8NAE3 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LINC01555Q8NAE3 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LINC01555Q8NAE3 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LINC01555Q8NAE3 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LINC01555Q8NAE3 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LINC01555Q8NAE3 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LINC01555Q8NAE3 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LINC01555Q8NAE3 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LINC01555Q8NAE3 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LINC01555Q8NAE3 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LINC01555Q8NAE3 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LINC01555Q8NAE3 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LINC01555Q8NAE3 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LINC01555Q8NAE3 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LINC01555Q8NAE3 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LINC01555Q8NAE3 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LINC01555Q8NAE3 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LINC01555Q8NAE3 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LINC01555Q8NAE3 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LINC01555Q8NAE3 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LINC01555Q8NAE3 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LINC01555Q8NAE3 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
LINC01555Q8NAE3 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LINC01555Q8NAE3 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LINC01555Q8NAE3 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LINC01555Q8NAE3 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LINC01555Q8NAE3 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LINC01555Q8NAE3 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LINC01555Q8NAE3 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LINC01555Q8NAE3 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LINC01555Q8NAE3 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LINC01555Q8NAE3 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LINC01555Q8NAE3 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LINC01555Q8NAE3 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LINC01555Q8NAE3 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LINC01555Q8NAE3 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LINC01555Q8NAE3 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LINC01555Q8NAE3 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LINC01555Q8NAE3 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LINC01555Q8NAE3 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LINC01555Q8NAE3 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LINC01555Q8NAE3 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LINC01555Q8NAE3 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LINC01555Q8NAE3 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LINC01555Q8NAE3 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LINC01555Q8NAE3 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LINC01555Q8NAE3 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LINC01555Q8NAE3 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LINC01555Q8NAE3 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LINC01555Q8NAE3 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LINC01555Q8NAE3 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LINC01555Q8NAE3 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LINC01555Q8NAE3 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LINC01555Q8NAE3 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LINC01555Q8NAE3 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LINC01555Q8NAE3 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LINC01555Q8NAE3 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LINC01555Q8NAE3 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LINC01555Q8NAE3 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LINC01555Q8NAE3 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LINC01555Q8NAE3 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LINC01555Q8NAE3 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
LINC01555Q8NAE3 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LINC01555Q8NAE3 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LINC01555Q8NAE3 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LINC01555Q8NAE3 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
LINC01555Q8NAE3 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
LINC01555Q8NAE3 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LINC01555Q8NAE3 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LINC01555Q8NAE3 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
LINC01555Q8NAE3 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LINC01555Q8NAE3 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LINC01555Q8NAE3 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LINC01555Q8NAE3 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LINC01555Q8NAE3 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LINC01555Q8NAE3 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms