Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5W5

SLC39A4, Zinc transporter ZIP4, humanhuman

Predictions only

Length 647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A4Q6P5W5 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC39A4Q6P5W5 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC39A4Q6P5W5 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC39A4Q6P5W5 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC39A4Q6P5W5 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC39A4Q6P5W5 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC39A4Q6P5W5 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC39A4Q6P5W5 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC39A4Q6P5W5 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC39A4Q6P5W5 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC39A4Q6P5W5 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC39A4Q6P5W5 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC39A4Q6P5W5 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC39A4Q6P5W5 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC39A4Q6P5W5 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC39A4Q6P5W5 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC39A4Q6P5W5 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC39A4Q6P5W5 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC39A4Q6P5W5 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC39A4Q6P5W5 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC39A4Q6P5W5 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC39A4Q6P5W5 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC39A4Q6P5W5 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC39A4Q6P5W5 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC39A4Q6P5W5 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SLC39A4Q6P5W5 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SLC39A4Q6P5W5 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC39A4Q6P5W5 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SLC39A4Q6P5W5 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC39A4Q6P5W5 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC39A4Q6P5W5 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC39A4Q6P5W5 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC39A4Q6P5W5 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SLC39A4Q6P5W5 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC39A4Q6P5W5 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC39A4Q6P5W5 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC39A4Q6P5W5 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC39A4Q6P5W5 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC39A4Q6P5W5 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC39A4Q6P5W5 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC39A4Q6P5W5 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC39A4Q6P5W5 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC39A4Q6P5W5 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC39A4Q6P5W5 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC39A4Q6P5W5 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC39A4Q6P5W5 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC39A4Q6P5W5 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC39A4Q6P5W5 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC39A4Q6P5W5 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC39A4Q6P5W5 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC39A4Q6P5W5 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC39A4Q6P5W5 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC39A4Q6P5W5 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC39A4Q6P5W5 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC39A4Q6P5W5 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC39A4Q6P5W5 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC39A4Q6P5W5 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC39A4Q6P5W5 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC39A4Q6P5W5 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC39A4Q6P5W5 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC39A4Q6P5W5 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC39A4Q6P5W5 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC39A4Q6P5W5 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC39A4Q6P5W5 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC39A4Q6P5W5 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC39A4Q6P5W5 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC39A4Q6P5W5 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC39A4Q6P5W5 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC39A4Q6P5W5 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC39A4Q6P5W5 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC39A4Q6P5W5 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC39A4Q6P5W5 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC39A4Q6P5W5 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC39A4Q6P5W5 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC39A4Q6P5W5 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC39A4Q6P5W5 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC39A4Q6P5W5 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC39A4Q6P5W5 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC39A4Q6P5W5 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC39A4Q6P5W5 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC39A4Q6P5W5 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC39A4Q6P5W5 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC39A4Q6P5W5 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC39A4Q6P5W5 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC39A4Q6P5W5 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC39A4Q6P5W5 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC39A4Q6P5W5 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC39A4Q6P5W5 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC39A4Q6P5W5 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC39A4Q6P5W5 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC39A4Q6P5W5 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC39A4Q6P5W5 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC39A4Q6P5W5 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC39A4Q6P5W5 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC39A4Q6P5W5 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC39A4Q6P5W5 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC39A4Q6P5W5 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC39A4Q6P5W5 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC39A4Q6P5W5 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC39A4Q6P5W5 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms