Protein–RNA interactions for Protein: P05023

ATP1A1, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,023 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A1P05023 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATP1A1P05023 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
ATP1A1P05023 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATP1A1P05023 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATP1A1P05023 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ATP1A1P05023 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
ATP1A1P05023 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ATP1A1P05023 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.52
ATP1A1P05023 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ATP1A1P05023 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATP1A1P05023 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATP1A1P05023 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATP1A1P05023 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATP1A1P05023 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATP1A1P05023 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATP1A1P05023 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATP1A1P05023 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATP1A1P05023 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATP1A1P05023 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATP1A1P05023 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATP1A1P05023 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATP1A1P05023 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATP1A1P05023 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATP1A1P05023 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
ATP1A1P05023 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATP1A1P05023 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATP1A1P05023 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATP1A1P05023 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATP1A1P05023 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
ATP1A1P05023 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATP1A1P05023 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATP1A1P05023 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATP1A1P05023 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATP1A1P05023 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATP1A1P05023 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATP1A1P05023 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATP1A1P05023 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATP1A1P05023 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATP1A1P05023 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATP1A1P05023 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATP1A1P05023 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATP1A1P05023 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATP1A1P05023 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATP1A1P05023 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATP1A1P05023 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATP1A1P05023 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATP1A1P05023 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATP1A1P05023 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
ATP1A1P05023 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATP1A1P05023 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATP1A1P05023 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATP1A1P05023 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATP1A1P05023 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATP1A1P05023 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATP1A1P05023 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATP1A1P05023 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATP1A1P05023 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATP1A1P05023 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATP1A1P05023 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATP1A1P05023 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATP1A1P05023 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATP1A1P05023 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATP1A1P05023 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATP1A1P05023 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATP1A1P05023 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATP1A1P05023 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATP1A1P05023 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATP1A1P05023 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATP1A1P05023 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATP1A1P05023 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATP1A1P05023 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
ATP1A1P05023 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATP1A1P05023 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATP1A1P05023 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATP1A1P05023 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATP1A1P05023 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATP1A1P05023 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATP1A1P05023 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATP1A1P05023 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATP1A1P05023 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATP1A1P05023 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATP1A1P05023 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATP1A1P05023 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATP1A1P05023 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATP1A1P05023 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATP1A1P05023 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
ATP1A1P05023 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATP1A1P05023 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATP1A1P05023 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATP1A1P05023 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATP1A1P05023 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATP1A1P05023 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
ATP1A1P05023 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATP1A1P05023 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATP1A1P05023 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATP1A1P05023 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATP1A1P05023 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATP1A1P05023 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATP1A1P05023 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATP1A1P05023 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 123.5 ms