RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000394202.8

CNN3-202, Transcript of calponin 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CNN3, Length 1,974 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN3-202ENST00000394202 NISCHQ9Y2I1 1504 aa54.07■■■■■ 6.25
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CNN3-202ENST00000394202 SMARCA2P51531 1590 aa41.06■■■■■ 4.16
CNN3-202ENST00000394202 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa41.04■■■■■ 4.16
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CNN3-202ENST00000394202 SYNJ1O43426 1573 aa39.16■■■■□ 3.86
CNN3-202ENST00000394202 CEP164Q9UPV0 1460 aa39.15■■■■□ 3.86
CNN3-202ENST00000394202 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa39.15■■■■□ 3.86
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CNN3-202ENST00000394202 TOP2BQ02880 1626 aa39.01■■■■□ 3.83
CNN3-202ENST00000394202 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa38.95■■■■□ 3.83
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CNN3-202ENST00000394202 TOPBP1Q92547 1522 aa38.88■■■■□ 3.81
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CNN3-202ENST00000394202 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa38.57■■■■□ 3.77
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CNN3-202ENST00000394202 KIF27Q86VH2 1401 aa38.32■■■■□ 3.73
CNN3-202ENST00000394202 CSRNP3Q8WYN3 585 aa38.3■■■■□ 3.72
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CNN3-202ENST00000394202 IFT140Q96RY7 1462 aa38.24■■■■□ 3.71
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