Protein–RNA interactions for Protein: Q5XG99

LYSMD4, LysM and putative peptidoglycan-binding domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYSMD4Q5XG99 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LYSMD4Q5XG99 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LYSMD4Q5XG99 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LYSMD4Q5XG99 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LYSMD4Q5XG99 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LYSMD4Q5XG99 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
LYSMD4Q5XG99 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LYSMD4Q5XG99 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LYSMD4Q5XG99 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LYSMD4Q5XG99 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LYSMD4Q5XG99 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LYSMD4Q5XG99 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LYSMD4Q5XG99 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LYSMD4Q5XG99 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LYSMD4Q5XG99 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LYSMD4Q5XG99 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LYSMD4Q5XG99 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LYSMD4Q5XG99 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LYSMD4Q5XG99 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LYSMD4Q5XG99 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LYSMD4Q5XG99 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LYSMD4Q5XG99 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LYSMD4Q5XG99 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LYSMD4Q5XG99 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LYSMD4Q5XG99 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LYSMD4Q5XG99 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
LYSMD4Q5XG99 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
LYSMD4Q5XG99 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LYSMD4Q5XG99 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LYSMD4Q5XG99 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LYSMD4Q5XG99 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LYSMD4Q5XG99 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LYSMD4Q5XG99 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
LYSMD4Q5XG99 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LYSMD4Q5XG99 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LYSMD4Q5XG99 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LYSMD4Q5XG99 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
LYSMD4Q5XG99 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LYSMD4Q5XG99 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
LYSMD4Q5XG99 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LYSMD4Q5XG99 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23■■□□□ 1.27
LYSMD4Q5XG99 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LYSMD4Q5XG99 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
LYSMD4Q5XG99 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LYSMD4Q5XG99 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
LYSMD4Q5XG99 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
LYSMD4Q5XG99 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LYSMD4Q5XG99 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
LYSMD4Q5XG99 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LYSMD4Q5XG99 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LYSMD4Q5XG99 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
LYSMD4Q5XG99 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
LYSMD4Q5XG99 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LYSMD4Q5XG99 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LYSMD4Q5XG99 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LYSMD4Q5XG99 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LYSMD4Q5XG99 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LYSMD4Q5XG99 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LYSMD4Q5XG99 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LYSMD4Q5XG99 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LYSMD4Q5XG99 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LYSMD4Q5XG99 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LYSMD4Q5XG99 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
LYSMD4Q5XG99 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LYSMD4Q5XG99 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LYSMD4Q5XG99 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LYSMD4Q5XG99 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LYSMD4Q5XG99 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LYSMD4Q5XG99 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LYSMD4Q5XG99 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LYSMD4Q5XG99 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LYSMD4Q5XG99 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LYSMD4Q5XG99 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LYSMD4Q5XG99 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LYSMD4Q5XG99 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LYSMD4Q5XG99 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
LYSMD4Q5XG99 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LYSMD4Q5XG99 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LYSMD4Q5XG99 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LYSMD4Q5XG99 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LYSMD4Q5XG99 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LYSMD4Q5XG99 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LYSMD4Q5XG99 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LYSMD4Q5XG99 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LYSMD4Q5XG99 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LYSMD4Q5XG99 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
LYSMD4Q5XG99 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LYSMD4Q5XG99 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LYSMD4Q5XG99 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LYSMD4Q5XG99 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LYSMD4Q5XG99 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LYSMD4Q5XG99 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LYSMD4Q5XG99 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LYSMD4Q5XG99 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LYSMD4Q5XG99 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LYSMD4Q5XG99 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LYSMD4Q5XG99 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LYSMD4Q5XG99 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
LYSMD4Q5XG99 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LYSMD4Q5XG99 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms