Protein–RNA interactions for Protein: P51587

BRCA2, Breast cancer type 2 susceptibility protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCA2P51587 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
BRCA2P51587 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
BRCA2P51587 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
BRCA2P51587 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
BRCA2P51587 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
BRCA2P51587 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
BRCA2P51587 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
BRCA2P51587 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
BRCA2P51587 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
BRCA2P51587 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
BRCA2P51587 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
BRCA2P51587 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
BRCA2P51587 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
BRCA2P51587 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
BRCA2P51587 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
BRCA2P51587 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
BRCA2P51587 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
BRCA2P51587 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
BRCA2P51587 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
BRCA2P51587 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
BRCA2P51587 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
BRCA2P51587 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
BRCA2P51587 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
BRCA2P51587 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
BRCA2P51587 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
BRCA2P51587 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
BRCA2P51587 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
BRCA2P51587 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
BRCA2P51587 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
BRCA2P51587 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
BRCA2P51587 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
BRCA2P51587 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
BRCA2P51587 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
BRCA2P51587 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
BRCA2P51587 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
BRCA2P51587 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
BRCA2P51587 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
BRCA2P51587 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
BRCA2P51587 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
BRCA2P51587 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
BRCA2P51587 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
BRCA2P51587 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
BRCA2P51587 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
BRCA2P51587 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
BRCA2P51587 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
BRCA2P51587 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
BRCA2P51587 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC26.34■■□□□ 1.81
BRCA2P51587 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
BRCA2P51587 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
BRCA2P51587 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
BRCA2P51587 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
BRCA2P51587 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
BRCA2P51587 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
BRCA2P51587 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
BRCA2P51587 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
BRCA2P51587 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
BRCA2P51587 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
BRCA2P51587 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
BRCA2P51587 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
BRCA2P51587 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
BRCA2P51587 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
BRCA2P51587 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
BRCA2P51587 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
BRCA2P51587 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
BRCA2P51587 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
BRCA2P51587 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
BRCA2P51587 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
BRCA2P51587 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
BRCA2P51587 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
BRCA2P51587 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC26.3■■□□□ 1.8
BRCA2P51587 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
BRCA2P51587 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
BRCA2P51587 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
BRCA2P51587 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
BRCA2P51587 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
BRCA2P51587 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
BRCA2P51587 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
BRCA2P51587 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
BRCA2P51587 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
BRCA2P51587 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
BRCA2P51587 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
BRCA2P51587 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
BRCA2P51587 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
BRCA2P51587 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
BRCA2P51587 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
BRCA2P51587 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
BRCA2P51587 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
BRCA2P51587 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
BRCA2P51587 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
BRCA2P51587 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
BRCA2P51587 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
BRCA2P51587 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
BRCA2P51587 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
BRCA2P51587 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
BRCA2P51587 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
BRCA2P51587 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
BRCA2P51587 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
BRCA2P51587 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
BRCA2P51587 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
BRCA2P51587 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 153.7 ms