Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQT6

FSCN3, Fascin-3, humanhuman

Predictions only

Length 498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSCN3Q9NQT6 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FSCN3Q9NQT6 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FSCN3Q9NQT6 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FSCN3Q9NQT6 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FSCN3Q9NQT6 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FSCN3Q9NQT6 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FSCN3Q9NQT6 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FSCN3Q9NQT6 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FSCN3Q9NQT6 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FSCN3Q9NQT6 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FSCN3Q9NQT6 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FSCN3Q9NQT6 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FSCN3Q9NQT6 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FSCN3Q9NQT6 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FSCN3Q9NQT6 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FSCN3Q9NQT6 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FSCN3Q9NQT6 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FSCN3Q9NQT6 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FSCN3Q9NQT6 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
FSCN3Q9NQT6 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FSCN3Q9NQT6 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
FSCN3Q9NQT6 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
FSCN3Q9NQT6 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
FSCN3Q9NQT6 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FSCN3Q9NQT6 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FSCN3Q9NQT6 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FSCN3Q9NQT6 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FSCN3Q9NQT6 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FSCN3Q9NQT6 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FSCN3Q9NQT6 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
FSCN3Q9NQT6 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FSCN3Q9NQT6 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FSCN3Q9NQT6 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FSCN3Q9NQT6 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FSCN3Q9NQT6 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
FSCN3Q9NQT6 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23■■□□□ 1.27
FSCN3Q9NQT6 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
FSCN3Q9NQT6 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
FSCN3Q9NQT6 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FSCN3Q9NQT6 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FSCN3Q9NQT6 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FSCN3Q9NQT6 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
FSCN3Q9NQT6 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FSCN3Q9NQT6 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FSCN3Q9NQT6 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FSCN3Q9NQT6 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
FSCN3Q9NQT6 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FSCN3Q9NQT6 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FSCN3Q9NQT6 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FSCN3Q9NQT6 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FSCN3Q9NQT6 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FSCN3Q9NQT6 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FSCN3Q9NQT6 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FSCN3Q9NQT6 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FSCN3Q9NQT6 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FSCN3Q9NQT6 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FSCN3Q9NQT6 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FSCN3Q9NQT6 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FSCN3Q9NQT6 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FSCN3Q9NQT6 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FSCN3Q9NQT6 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FSCN3Q9NQT6 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FSCN3Q9NQT6 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FSCN3Q9NQT6 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FSCN3Q9NQT6 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FSCN3Q9NQT6 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FSCN3Q9NQT6 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FSCN3Q9NQT6 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FSCN3Q9NQT6 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
FSCN3Q9NQT6 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FSCN3Q9NQT6 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FSCN3Q9NQT6 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FSCN3Q9NQT6 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FSCN3Q9NQT6 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FSCN3Q9NQT6 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FSCN3Q9NQT6 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FSCN3Q9NQT6 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FSCN3Q9NQT6 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FSCN3Q9NQT6 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FSCN3Q9NQT6 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
FSCN3Q9NQT6 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FSCN3Q9NQT6 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FSCN3Q9NQT6 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FSCN3Q9NQT6 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FSCN3Q9NQT6 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
FSCN3Q9NQT6 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FSCN3Q9NQT6 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FSCN3Q9NQT6 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FSCN3Q9NQT6 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FSCN3Q9NQT6 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FSCN3Q9NQT6 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
FSCN3Q9NQT6 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
FSCN3Q9NQT6 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FSCN3Q9NQT6 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FSCN3Q9NQT6 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FSCN3Q9NQT6 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FSCN3Q9NQT6 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FSCN3Q9NQT6 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FSCN3Q9NQT6 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FSCN3Q9NQT6 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms