Protein–RNA interactions for Protein: Q01082

SPTBN1, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBN1Q01082 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SPTBN1Q01082 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SPTBN1Q01082 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SPTBN1Q01082 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SPTBN1Q01082 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SPTBN1Q01082 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
SPTBN1Q01082 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SPTBN1Q01082 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SPTBN1Q01082 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SPTBN1Q01082 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SPTBN1Q01082 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
SPTBN1Q01082 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SPTBN1Q01082 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SPTBN1Q01082 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SPTBN1Q01082 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SPTBN1Q01082 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SPTBN1Q01082 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SPTBN1Q01082 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SPTBN1Q01082 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SPTBN1Q01082 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
SPTBN1Q01082 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SPTBN1Q01082 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SPTBN1Q01082 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SPTBN1Q01082 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SPTBN1Q01082 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
SPTBN1Q01082 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SPTBN1Q01082 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SPTBN1Q01082 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SPTBN1Q01082 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SPTBN1Q01082 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SPTBN1Q01082 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SPTBN1Q01082 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SPTBN1Q01082 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SPTBN1Q01082 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SPTBN1Q01082 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SPTBN1Q01082 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SPTBN1Q01082 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SPTBN1Q01082 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SPTBN1Q01082 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SPTBN1Q01082 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SPTBN1Q01082 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SPTBN1Q01082 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SPTBN1Q01082 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SPTBN1Q01082 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
SPTBN1Q01082 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SPTBN1Q01082 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SPTBN1Q01082 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SPTBN1Q01082 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SPTBN1Q01082 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SPTBN1Q01082 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SPTBN1Q01082 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SPTBN1Q01082 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SPTBN1Q01082 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SPTBN1Q01082 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
SPTBN1Q01082 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SPTBN1Q01082 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SPTBN1Q01082 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SPTBN1Q01082 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SPTBN1Q01082 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SPTBN1Q01082 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SPTBN1Q01082 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SPTBN1Q01082 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SPTBN1Q01082 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SPTBN1Q01082 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SPTBN1Q01082 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SPTBN1Q01082 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SPTBN1Q01082 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SPTBN1Q01082 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SPTBN1Q01082 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SPTBN1Q01082 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SPTBN1Q01082 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SPTBN1Q01082 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SPTBN1Q01082 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SPTBN1Q01082 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SPTBN1Q01082 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SPTBN1Q01082 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SPTBN1Q01082 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SPTBN1Q01082 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SPTBN1Q01082 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SPTBN1Q01082 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
SPTBN1Q01082 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
SPTBN1Q01082 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SPTBN1Q01082 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SPTBN1Q01082 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SPTBN1Q01082 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SPTBN1Q01082 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SPTBN1Q01082 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SPTBN1Q01082 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SPTBN1Q01082 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SPTBN1Q01082 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SPTBN1Q01082 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
SPTBN1Q01082 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SPTBN1Q01082 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SPTBN1Q01082 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SPTBN1Q01082 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SPTBN1Q01082 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SPTBN1Q01082 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SPTBN1Q01082 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SPTBN1Q01082 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SPTBN1Q01082 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms