Protein–RNA interactions for Protein: O75164

KDM4A, Lysine-specific demethylase 4A, humanhuman

Predictions only

Length 1,064 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM4AO75164 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
KDM4AO75164 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
KDM4AO75164 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
KDM4AO75164 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
KDM4AO75164 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
KDM4AO75164 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
KDM4AO75164 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
KDM4AO75164 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
KDM4AO75164 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
KDM4AO75164 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
KDM4AO75164 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
KDM4AO75164 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
KDM4AO75164 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
KDM4AO75164 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
KDM4AO75164 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
KDM4AO75164 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
KDM4AO75164 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
KDM4AO75164 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
KDM4AO75164 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
KDM4AO75164 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
KDM4AO75164 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
KDM4AO75164 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
KDM4AO75164 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
KDM4AO75164 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
KDM4AO75164 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
KDM4AO75164 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
KDM4AO75164 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
KDM4AO75164 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
KDM4AO75164 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
KDM4AO75164 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
KDM4AO75164 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
KDM4AO75164 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
KDM4AO75164 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
KDM4AO75164 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
KDM4AO75164 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
KDM4AO75164 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
KDM4AO75164 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
KDM4AO75164 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
KDM4AO75164 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
KDM4AO75164 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
KDM4AO75164 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
KDM4AO75164 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
KDM4AO75164 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
KDM4AO75164 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
KDM4AO75164 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
KDM4AO75164 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
KDM4AO75164 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
KDM4AO75164 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
KDM4AO75164 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
KDM4AO75164 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
KDM4AO75164 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
KDM4AO75164 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
KDM4AO75164 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
KDM4AO75164 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
KDM4AO75164 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
KDM4AO75164 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
KDM4AO75164 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
KDM4AO75164 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
KDM4AO75164 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
KDM4AO75164 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
KDM4AO75164 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
KDM4AO75164 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
KDM4AO75164 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
KDM4AO75164 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
KDM4AO75164 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
KDM4AO75164 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
KDM4AO75164 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
KDM4AO75164 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
KDM4AO75164 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
KDM4AO75164 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
KDM4AO75164 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
KDM4AO75164 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
KDM4AO75164 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
KDM4AO75164 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
KDM4AO75164 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
KDM4AO75164 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
KDM4AO75164 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
KDM4AO75164 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
KDM4AO75164 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
KDM4AO75164 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
KDM4AO75164 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
KDM4AO75164 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
KDM4AO75164 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
KDM4AO75164 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
KDM4AO75164 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
KDM4AO75164 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
KDM4AO75164 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
KDM4AO75164 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
KDM4AO75164 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
KDM4AO75164 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
KDM4AO75164 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
KDM4AO75164 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
KDM4AO75164 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
KDM4AO75164 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
KDM4AO75164 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
KDM4AO75164 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
KDM4AO75164 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
KDM4AO75164 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
KDM4AO75164 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
KDM4AO75164 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77 ms