Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGL1

KDM5B, Lysine-specific demethylase 5B, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5BQ9UGL1 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC37.27■■■■□ 3.56
KDM5BQ9UGL1 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
KDM5BQ9UGL1 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC37.27■■■■□ 3.56
KDM5BQ9UGL1 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC37.26■■■■□ 3.56
KDM5BQ9UGL1 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC37.26■■■■□ 3.56
KDM5BQ9UGL1 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.26■■■■□ 3.56
KDM5BQ9UGL1 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.26■■■■□ 3.56
KDM5BQ9UGL1 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.55
KDM5BQ9UGL1 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.55
KDM5BQ9UGL1 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.55
KDM5BQ9UGL1 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC37.26■■■■□ 3.55
KDM5BQ9UGL1 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.25■■■■□ 3.55
KDM5BQ9UGL1 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
KDM5BQ9UGL1 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
KDM5BQ9UGL1 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
KDM5BQ9UGL1 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
KDM5BQ9UGL1 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
KDM5BQ9UGL1 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
KDM5BQ9UGL1 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC37.24■■■■□ 3.55
KDM5BQ9UGL1 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
KDM5BQ9UGL1 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC37.23■■■■□ 3.55
KDM5BQ9UGL1 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
KDM5BQ9UGL1 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
KDM5BQ9UGL1 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
KDM5BQ9UGL1 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC37.22■■■■□ 3.55
KDM5BQ9UGL1 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
KDM5BQ9UGL1 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
KDM5BQ9UGL1 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.21■■■■□ 3.55
KDM5BQ9UGL1 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC37.21■■■■□ 3.55
KDM5BQ9UGL1 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
KDM5BQ9UGL1 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.21■■■■□ 3.55
KDM5BQ9UGL1 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
KDM5BQ9UGL1 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC37.21■■■■□ 3.55
KDM5BQ9UGL1 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
KDM5BQ9UGL1 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
KDM5BQ9UGL1 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC37.2■■■■□ 3.55
KDM5BQ9UGL1 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC37.2■■■■□ 3.55
KDM5BQ9UGL1 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.2■■■■□ 3.55
KDM5BQ9UGL1 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
KDM5BQ9UGL1 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC37.2■■■■□ 3.55
KDM5BQ9UGL1 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC37.2■■■■□ 3.55
KDM5BQ9UGL1 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.54
KDM5BQ9UGL1 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC37.19■■■■□ 3.54
KDM5BQ9UGL1 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.19■■■■□ 3.54
KDM5BQ9UGL1 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC37.19■■■■□ 3.54
KDM5BQ9UGL1 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
KDM5BQ9UGL1 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC37.19■■■■□ 3.54
KDM5BQ9UGL1 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
KDM5BQ9UGL1 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
KDM5BQ9UGL1 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC37.18■■■■□ 3.54
KDM5BQ9UGL1 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
KDM5BQ9UGL1 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.18■■■■□ 3.54
KDM5BQ9UGL1 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.18■■■■□ 3.54
KDM5BQ9UGL1 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
KDM5BQ9UGL1 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC37.17■■■■□ 3.54
KDM5BQ9UGL1 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC37.17■■■■□ 3.54
KDM5BQ9UGL1 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.17■■■■□ 3.54
KDM5BQ9UGL1 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC37.17■■■■□ 3.54
KDM5BQ9UGL1 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.17■■■■□ 3.54
KDM5BQ9UGL1 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
KDM5BQ9UGL1 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
KDM5BQ9UGL1 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
KDM5BQ9UGL1 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC37.15■■■■□ 3.54
KDM5BQ9UGL1 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC37.15■■■■□ 3.54
KDM5BQ9UGL1 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
KDM5BQ9UGL1 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
KDM5BQ9UGL1 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
KDM5BQ9UGL1 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC37.15■■■■□ 3.54
KDM5BQ9UGL1 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC37.14■■■■□ 3.54
KDM5BQ9UGL1 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC37.14■■■■□ 3.54
KDM5BQ9UGL1 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
KDM5BQ9UGL1 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
KDM5BQ9UGL1 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.13■■■■□ 3.53
KDM5BQ9UGL1 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC37.13■■■■□ 3.53
KDM5BQ9UGL1 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC37.13■■■■□ 3.53
KDM5BQ9UGL1 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC37.13■■■■□ 3.53
KDM5BQ9UGL1 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
KDM5BQ9UGL1 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
KDM5BQ9UGL1 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
KDM5BQ9UGL1 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC37.12■■■■□ 3.53
KDM5BQ9UGL1 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
KDM5BQ9UGL1 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
KDM5BQ9UGL1 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
KDM5BQ9UGL1 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
KDM5BQ9UGL1 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
KDM5BQ9UGL1 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC37.1■■■■□ 3.53
KDM5BQ9UGL1 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
KDM5BQ9UGL1 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
KDM5BQ9UGL1 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
KDM5BQ9UGL1 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
KDM5BQ9UGL1 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC37.08■■■■□ 3.53
KDM5BQ9UGL1 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
KDM5BQ9UGL1 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC37.08■■■■□ 3.53
KDM5BQ9UGL1 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
KDM5BQ9UGL1 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC37.08■■■■□ 3.53
KDM5BQ9UGL1 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
KDM5BQ9UGL1 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.53
KDM5BQ9UGL1 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.07■■■■□ 3.53
KDM5BQ9UGL1 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
KDM5BQ9UGL1 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC37.07■■■■□ 3.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms