Protein–RNA interactions for Protein: Q92547

TOPBP1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPBP1Q92547 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC40.24■■■■■ 4.03
TOPBP1Q92547 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.24■■■■■ 4.03
TOPBP1Q92547 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC40.23■■■■■ 4.03
TOPBP1Q92547 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.22■■■■■ 4.03
TOPBP1Q92547 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC40.22■■■■■ 4.03
TOPBP1Q92547 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC40.21■■■■■ 4.03
TOPBP1Q92547 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC40.21■■■■■ 4.03
TOPBP1Q92547 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC40.21■■■■■ 4.03
TOPBP1Q92547 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.21■■■■■ 4.03
TOPBP1Q92547 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC40.21■■■■■ 4.03
TOPBP1Q92547 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC40.2■■■■■ 4.03
TOPBP1Q92547 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.2■■■■■ 4.03
TOPBP1Q92547 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC40.2■■■■■ 4.03
TOPBP1Q92547 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC40.2■■■■■ 4.03
TOPBP1Q92547 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.19■■■■■ 4.02
TOPBP1Q92547 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.19■■■■■ 4.02
TOPBP1Q92547 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC40.19■■■■■ 4.02
TOPBP1Q92547 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.19■■■■■ 4.02
TOPBP1Q92547 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC40.19■■■■■ 4.02
TOPBP1Q92547 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC40.18■■■■■ 4.02
TOPBP1Q92547 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
TOPBP1Q92547 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.18■■■■■ 4.02
TOPBP1Q92547 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
TOPBP1Q92547 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC40.17■■■■■ 4.02
TOPBP1Q92547 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.17■■■■■ 4.02
TOPBP1Q92547 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC40.16■■■■■ 4.02
TOPBP1Q92547 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC40.16■■■■■ 4.02
TOPBP1Q92547 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.16■■■■■ 4.02
TOPBP1Q92547 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.16■■■■■ 4.02
TOPBP1Q92547 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC40.16■■■■■ 4.02
TOPBP1Q92547 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC40.16■■■■■ 4.02
TOPBP1Q92547 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC40.15■■■■■ 4.02
TOPBP1Q92547 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC40.15■■■■■ 4.02
TOPBP1Q92547 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC40.15■■■■■ 4.02
TOPBP1Q92547 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC40.14■■■■■ 4.02
TOPBP1Q92547 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC40.14■■■■■ 4.02
TOPBP1Q92547 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC40.14■■■■■ 4.02
TOPBP1Q92547 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.14■■■■■ 4.02
TOPBP1Q92547 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.14■■■■■ 4.02
TOPBP1Q92547 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC40.14■■■■■ 4.02
TOPBP1Q92547 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.14■■■■■ 4.02
TOPBP1Q92547 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC40.14■■■■■ 4.02
TOPBP1Q92547 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.01
TOPBP1Q92547 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.12■■■■■ 4.01
TOPBP1Q92547 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC40.12■■■■■ 4.01
TOPBP1Q92547 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.12■■■■■ 4.01
TOPBP1Q92547 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.11■■■■■ 4.01
TOPBP1Q92547 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC40.11■■■■■ 4.01
TOPBP1Q92547 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC40.11■■■■■ 4.01
TOPBP1Q92547 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
TOPBP1Q92547 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC40.1■■■■■ 4.01
TOPBP1Q92547 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.09■■■■■ 4.01
TOPBP1Q92547 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC40.09■■■■■ 4.01
TOPBP1Q92547 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.09■■■■■ 4.01
TOPBP1Q92547 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC40.08■■■■■ 4.01
TOPBP1Q92547 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC40.08■■■■■ 4.01
TOPBP1Q92547 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.07■■■■■ 4
TOPBP1Q92547 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.07■■■■■ 4
TOPBP1Q92547 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.07■■■■■ 4
TOPBP1Q92547 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC40.06■■■■■ 4
TOPBP1Q92547 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
TOPBP1Q92547 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC40.06■■■■■ 4
TOPBP1Q92547 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
TOPBP1Q92547 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
TOPBP1Q92547 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
TOPBP1Q92547 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.05■■■■■ 4
TOPBP1Q92547 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC40.05■■■■■ 4
TOPBP1Q92547 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC40.05■■■■■ 4
TOPBP1Q92547 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC40.05■■■■■ 4
TOPBP1Q92547 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC40.04■■■■■ 4
TOPBP1Q92547 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC40.04■■■■■ 4
TOPBP1Q92547 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC40.04■■■■■ 4
TOPBP1Q92547 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.03■■■■■ 4
TOPBP1Q92547 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC40.03■■■■■ 4
TOPBP1Q92547 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.03■■■■■ 4
TOPBP1Q92547 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC40.03■■■■■ 4
TOPBP1Q92547 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.03■■■■■ 4
TOPBP1Q92547 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC40.02■■■■■ 4
TOPBP1Q92547 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC40.01■■■■■ 4
TOPBP1Q92547 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.01■■■■■ 4
TOPBP1Q92547 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.01■■■■■ 4
TOPBP1Q92547 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40■■■■□ 3.99
TOPBP1Q92547 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC40■■■■□ 3.99
TOPBP1Q92547 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.99■■■■□ 3.99
TOPBP1Q92547 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.99■■■■□ 3.99
TOPBP1Q92547 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC39.99■■■■□ 3.99
TOPBP1Q92547 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.99■■■■□ 3.99
TOPBP1Q92547 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.98■■■■□ 3.99
TOPBP1Q92547 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.98■■■■□ 3.99
TOPBP1Q92547 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.98■■■■□ 3.99
TOPBP1Q92547 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.98■■■■□ 3.99
TOPBP1Q92547 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC39.97■■■■□ 3.99
TOPBP1Q92547 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC39.97■■■■□ 3.99
TOPBP1Q92547 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC39.97■■■■□ 3.99
TOPBP1Q92547 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC39.96■■■■□ 3.99
TOPBP1Q92547 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC39.96■■■■□ 3.99
TOPBP1Q92547 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.96■■■■□ 3.99
TOPBP1Q92547 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC39.96■■■■□ 3.99
TOPBP1Q92547 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC39.96■■■■□ 3.99
TOPBP1Q92547 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC39.96■■■■□ 3.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms