Protein–RNA interactions for Protein: Q6NUP7

PPP4R4, Serine/threonine-protein phosphatase 4 regulatory subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP4R4Q6NUP7 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PPP4R4Q6NUP7 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPP4R4Q6NUP7 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPP4R4Q6NUP7 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPP4R4Q6NUP7 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPP4R4Q6NUP7 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPP4R4Q6NUP7 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPP4R4Q6NUP7 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPP4R4Q6NUP7 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPP4R4Q6NUP7 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPP4R4Q6NUP7 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPP4R4Q6NUP7 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPP4R4Q6NUP7 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPP4R4Q6NUP7 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPP4R4Q6NUP7 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPP4R4Q6NUP7 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPP4R4Q6NUP7 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPP4R4Q6NUP7 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPP4R4Q6NUP7 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPP4R4Q6NUP7 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPP4R4Q6NUP7 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PPP4R4Q6NUP7 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PPP4R4Q6NUP7 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PPP4R4Q6NUP7 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PPP4R4Q6NUP7 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PPP4R4Q6NUP7 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PPP4R4Q6NUP7 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PPP4R4Q6NUP7 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PPP4R4Q6NUP7 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PPP4R4Q6NUP7 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PPP4R4Q6NUP7 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PPP4R4Q6NUP7 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PPP4R4Q6NUP7 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PPP4R4Q6NUP7 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PPP4R4Q6NUP7 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PPP4R4Q6NUP7 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PPP4R4Q6NUP7 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PPP4R4Q6NUP7 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PPP4R4Q6NUP7 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PPP4R4Q6NUP7 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PPP4R4Q6NUP7 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PPP4R4Q6NUP7 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PPP4R4Q6NUP7 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PPP4R4Q6NUP7 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PPP4R4Q6NUP7 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PPP4R4Q6NUP7 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PPP4R4Q6NUP7 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PPP4R4Q6NUP7 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PPP4R4Q6NUP7 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PPP4R4Q6NUP7 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PPP4R4Q6NUP7 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PPP4R4Q6NUP7 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PPP4R4Q6NUP7 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
PPP4R4Q6NUP7 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
PPP4R4Q6NUP7 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PPP4R4Q6NUP7 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PPP4R4Q6NUP7 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PPP4R4Q6NUP7 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PPP4R4Q6NUP7 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PPP4R4Q6NUP7 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PPP4R4Q6NUP7 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PPP4R4Q6NUP7 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PPP4R4Q6NUP7 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PPP4R4Q6NUP7 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PPP4R4Q6NUP7 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PPP4R4Q6NUP7 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PPP4R4Q6NUP7 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PPP4R4Q6NUP7 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PPP4R4Q6NUP7 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PPP4R4Q6NUP7 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PPP4R4Q6NUP7 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PPP4R4Q6NUP7 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PPP4R4Q6NUP7 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PPP4R4Q6NUP7 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PPP4R4Q6NUP7 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PPP4R4Q6NUP7 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PPP4R4Q6NUP7 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PPP4R4Q6NUP7 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PPP4R4Q6NUP7 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PPP4R4Q6NUP7 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PPP4R4Q6NUP7 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PPP4R4Q6NUP7 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PPP4R4Q6NUP7 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PPP4R4Q6NUP7 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PPP4R4Q6NUP7 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PPP4R4Q6NUP7 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PPP4R4Q6NUP7 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PPP4R4Q6NUP7 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PPP4R4Q6NUP7 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPP4R4Q6NUP7 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPP4R4Q6NUP7 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPP4R4Q6NUP7 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPP4R4Q6NUP7 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPP4R4Q6NUP7 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPP4R4Q6NUP7 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPP4R4Q6NUP7 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPP4R4Q6NUP7 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PPP4R4Q6NUP7 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PPP4R4Q6NUP7 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PPP4R4Q6NUP7 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 947.1 ms