Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

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Length 1,142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL19A1Q14993 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
COL19A1Q14993 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
COL19A1Q14993 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
COL19A1Q14993 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
COL19A1Q14993 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
COL19A1Q14993 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
COL19A1Q14993 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
COL19A1Q14993 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
COL19A1Q14993 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
COL19A1Q14993 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
COL19A1Q14993 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
COL19A1Q14993 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
COL19A1Q14993 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
COL19A1Q14993 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
COL19A1Q14993 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
COL19A1Q14993 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
COL19A1Q14993 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
COL19A1Q14993 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
COL19A1Q14993 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
COL19A1Q14993 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
COL19A1Q14993 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
COL19A1Q14993 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
COL19A1Q14993 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
COL19A1Q14993 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
COL19A1Q14993 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
COL19A1Q14993 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
COL19A1Q14993 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
COL19A1Q14993 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
COL19A1Q14993 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
COL19A1Q14993 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
COL19A1Q14993 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
COL19A1Q14993 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
COL19A1Q14993 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
COL19A1Q14993 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
COL19A1Q14993 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
COL19A1Q14993 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
COL19A1Q14993 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
COL19A1Q14993 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
COL19A1Q14993 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
COL19A1Q14993 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
COL19A1Q14993 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
COL19A1Q14993 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
COL19A1Q14993 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
COL19A1Q14993 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
COL19A1Q14993 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
COL19A1Q14993 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
COL19A1Q14993 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
COL19A1Q14993 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
COL19A1Q14993 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
COL19A1Q14993 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
COL19A1Q14993 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
COL19A1Q14993 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
COL19A1Q14993 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
COL19A1Q14993 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
COL19A1Q14993 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
COL19A1Q14993 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
COL19A1Q14993 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
COL19A1Q14993 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
COL19A1Q14993 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
COL19A1Q14993 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
COL19A1Q14993 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
COL19A1Q14993 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
COL19A1Q14993 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
COL19A1Q14993 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
COL19A1Q14993 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
COL19A1Q14993 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
COL19A1Q14993 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
COL19A1Q14993 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
COL19A1Q14993 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
COL19A1Q14993 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
COL19A1Q14993 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
COL19A1Q14993 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
COL19A1Q14993 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
COL19A1Q14993 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
COL19A1Q14993 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
COL19A1Q14993 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
COL19A1Q14993 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
COL19A1Q14993 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
COL19A1Q14993 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
COL19A1Q14993 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
COL19A1Q14993 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
COL19A1Q14993 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
COL19A1Q14993 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
COL19A1Q14993 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
COL19A1Q14993 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
COL19A1Q14993 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
COL19A1Q14993 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
COL19A1Q14993 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
COL19A1Q14993 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
COL19A1Q14993 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
COL19A1Q14993 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
COL19A1Q14993 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
COL19A1Q14993 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
COL19A1Q14993 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
COL19A1Q14993 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
COL19A1Q14993 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
COL19A1Q14993 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
COL19A1Q14993 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
COL19A1Q14993 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
COL19A1Q14993 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
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