Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y679

AUP1, Ancient ubiquitous protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AUP1Q9Y679 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
AUP1Q9Y679 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
AUP1Q9Y679 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
AUP1Q9Y679 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
AUP1Q9Y679 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
AUP1Q9Y679 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
AUP1Q9Y679 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
AUP1Q9Y679 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
AUP1Q9Y679 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
AUP1Q9Y679 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
AUP1Q9Y679 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
AUP1Q9Y679 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
AUP1Q9Y679 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
AUP1Q9Y679 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
AUP1Q9Y679 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
AUP1Q9Y679 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
AUP1Q9Y679 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
AUP1Q9Y679 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
AUP1Q9Y679 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
AUP1Q9Y679 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
AUP1Q9Y679 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
AUP1Q9Y679 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
AUP1Q9Y679 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
AUP1Q9Y679 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
AUP1Q9Y679 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
AUP1Q9Y679 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
AUP1Q9Y679 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
AUP1Q9Y679 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
AUP1Q9Y679 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
AUP1Q9Y679 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
AUP1Q9Y679 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
AUP1Q9Y679 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
AUP1Q9Y679 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
AUP1Q9Y679 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
AUP1Q9Y679 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
AUP1Q9Y679 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
AUP1Q9Y679 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
AUP1Q9Y679 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
AUP1Q9Y679 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
AUP1Q9Y679 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
AUP1Q9Y679 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
AUP1Q9Y679 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
AUP1Q9Y679 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
AUP1Q9Y679 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
AUP1Q9Y679 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
AUP1Q9Y679 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
AUP1Q9Y679 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
AUP1Q9Y679 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
AUP1Q9Y679 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
AUP1Q9Y679 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
AUP1Q9Y679 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
AUP1Q9Y679 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
AUP1Q9Y679 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
AUP1Q9Y679 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
AUP1Q9Y679 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
AUP1Q9Y679 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
AUP1Q9Y679 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
AUP1Q9Y679 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
AUP1Q9Y679 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
AUP1Q9Y679 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
AUP1Q9Y679 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
AUP1Q9Y679 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
AUP1Q9Y679 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
AUP1Q9Y679 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
AUP1Q9Y679 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
AUP1Q9Y679 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
AUP1Q9Y679 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
AUP1Q9Y679 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
AUP1Q9Y679 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
AUP1Q9Y679 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
AUP1Q9Y679 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
AUP1Q9Y679 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
AUP1Q9Y679 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
AUP1Q9Y679 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
AUP1Q9Y679 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
AUP1Q9Y679 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
AUP1Q9Y679 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
AUP1Q9Y679 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
AUP1Q9Y679 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
AUP1Q9Y679 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
AUP1Q9Y679 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
AUP1Q9Y679 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
AUP1Q9Y679 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
AUP1Q9Y679 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
AUP1Q9Y679 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
AUP1Q9Y679 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
AUP1Q9Y679 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
AUP1Q9Y679 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
AUP1Q9Y679 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
AUP1Q9Y679 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
AUP1Q9Y679 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
AUP1Q9Y679 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
AUP1Q9Y679 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
AUP1Q9Y679 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
AUP1Q9Y679 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
AUP1Q9Y679 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
AUP1Q9Y679 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
AUP1Q9Y679 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
AUP1Q9Y679 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
AUP1Q9Y679 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74 ms