Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
USP18Q9UMW8 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
USP18Q9UMW8 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
USP18Q9UMW8 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
USP18Q9UMW8 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.36■■■□□ 2.45
USP18Q9UMW8 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
USP18Q9UMW8 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
USP18Q9UMW8 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
USP18Q9UMW8 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
USP18Q9UMW8 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
USP18Q9UMW8 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC30.25■■■□□ 2.43
USP18Q9UMW8 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
USP18Q9UMW8 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
USP18Q9UMW8 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
USP18Q9UMW8 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
USP18Q9UMW8 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
USP18Q9UMW8 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
USP18Q9UMW8 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC30.17■■■□□ 2.42
USP18Q9UMW8 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC30.16■■■□□ 2.42
USP18Q9UMW8 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC30.13■■■□□ 2.41
USP18Q9UMW8 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
USP18Q9UMW8 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
USP18Q9UMW8 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
USP18Q9UMW8 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
USP18Q9UMW8 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
USP18Q9UMW8 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
USP18Q9UMW8 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
USP18Q9UMW8 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
USP18Q9UMW8 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
USP18Q9UMW8 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
USP18Q9UMW8 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
USP18Q9UMW8 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
USP18Q9UMW8 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
USP18Q9UMW8 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
USP18Q9UMW8 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
USP18Q9UMW8 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
USP18Q9UMW8 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
USP18Q9UMW8 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
USP18Q9UMW8 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
USP18Q9UMW8 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
USP18Q9UMW8 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
USP18Q9UMW8 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
USP18Q9UMW8 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
USP18Q9UMW8 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
USP18Q9UMW8 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
USP18Q9UMW8 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
USP18Q9UMW8 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
USP18Q9UMW8 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
USP18Q9UMW8 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
USP18Q9UMW8 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
USP18Q9UMW8 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
USP18Q9UMW8 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
USP18Q9UMW8 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
USP18Q9UMW8 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
USP18Q9UMW8 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
USP18Q9UMW8 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
USP18Q9UMW8 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
USP18Q9UMW8 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
USP18Q9UMW8 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
USP18Q9UMW8 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
USP18Q9UMW8 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
USP18Q9UMW8 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
USP18Q9UMW8 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
USP18Q9UMW8 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
USP18Q9UMW8 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
USP18Q9UMW8 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
USP18Q9UMW8 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
USP18Q9UMW8 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
USP18Q9UMW8 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
USP18Q9UMW8 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
USP18Q9UMW8 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
USP18Q9UMW8 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
USP18Q9UMW8 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
USP18Q9UMW8 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
USP18Q9UMW8 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
USP18Q9UMW8 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
USP18Q9UMW8 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
USP18Q9UMW8 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
USP18Q9UMW8 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
USP18Q9UMW8 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
USP18Q9UMW8 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
USP18Q9UMW8 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
USP18Q9UMW8 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
USP18Q9UMW8 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
USP18Q9UMW8 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
USP18Q9UMW8 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
USP18Q9UMW8 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
USP18Q9UMW8 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
USP18Q9UMW8 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
USP18Q9UMW8 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
USP18Q9UMW8 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
USP18Q9UMW8 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
USP18Q9UMW8 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
USP18Q9UMW8 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
USP18Q9UMW8 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
USP18Q9UMW8 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
USP18Q9UMW8 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
USP18Q9UMW8 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
USP18Q9UMW8 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
USP18Q9UMW8 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
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