Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK11

ZNF223, Zinc finger protein 223, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF223Q9UK11 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ZNF223Q9UK11 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ZNF223Q9UK11 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ZNF223Q9UK11 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ZNF223Q9UK11 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ZNF223Q9UK11 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ZNF223Q9UK11 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ZNF223Q9UK11 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ZNF223Q9UK11 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ZNF223Q9UK11 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ZNF223Q9UK11 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
ZNF223Q9UK11 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ZNF223Q9UK11 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ZNF223Q9UK11 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
ZNF223Q9UK11 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
ZNF223Q9UK11 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ZNF223Q9UK11 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ZNF223Q9UK11 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
ZNF223Q9UK11 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ZNF223Q9UK11 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ZNF223Q9UK11 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ZNF223Q9UK11 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ZNF223Q9UK11 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ZNF223Q9UK11 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ZNF223Q9UK11 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ZNF223Q9UK11 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ZNF223Q9UK11 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ZNF223Q9UK11 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ZNF223Q9UK11 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ZNF223Q9UK11 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ZNF223Q9UK11 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ZNF223Q9UK11 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ZNF223Q9UK11 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ZNF223Q9UK11 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
ZNF223Q9UK11 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ZNF223Q9UK11 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ZNF223Q9UK11 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ZNF223Q9UK11 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ZNF223Q9UK11 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ZNF223Q9UK11 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ZNF223Q9UK11 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ZNF223Q9UK11 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ZNF223Q9UK11 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ZNF223Q9UK11 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ZNF223Q9UK11 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ZNF223Q9UK11 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ZNF223Q9UK11 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ZNF223Q9UK11 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ZNF223Q9UK11 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ZNF223Q9UK11 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ZNF223Q9UK11 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ZNF223Q9UK11 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ZNF223Q9UK11 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ZNF223Q9UK11 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ZNF223Q9UK11 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ZNF223Q9UK11 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ZNF223Q9UK11 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ZNF223Q9UK11 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ZNF223Q9UK11 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ZNF223Q9UK11 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ZNF223Q9UK11 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ZNF223Q9UK11 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ZNF223Q9UK11 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ZNF223Q9UK11 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ZNF223Q9UK11 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ZNF223Q9UK11 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ZNF223Q9UK11 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ZNF223Q9UK11 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ZNF223Q9UK11 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ZNF223Q9UK11 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ZNF223Q9UK11 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ZNF223Q9UK11 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ZNF223Q9UK11 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ZNF223Q9UK11 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ZNF223Q9UK11 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ZNF223Q9UK11 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ZNF223Q9UK11 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ZNF223Q9UK11 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ZNF223Q9UK11 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ZNF223Q9UK11 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ZNF223Q9UK11 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ZNF223Q9UK11 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ZNF223Q9UK11 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
ZNF223Q9UK11 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ZNF223Q9UK11 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ZNF223Q9UK11 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ZNF223Q9UK11 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ZNF223Q9UK11 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ZNF223Q9UK11 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ZNF223Q9UK11 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ZNF223Q9UK11 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ZNF223Q9UK11 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ZNF223Q9UK11 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ZNF223Q9UK11 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ZNF223Q9UK11 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ZNF223Q9UK11 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ZNF223Q9UK11 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ZNF223Q9UK11 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ZNF223Q9UK11 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ZNF223Q9UK11 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms