Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP90

RAB9B, Ras-related protein Rab-9B, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB9BQ9NP90 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RAB9BQ9NP90 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RAB9BQ9NP90 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RAB9BQ9NP90 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RAB9BQ9NP90 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RAB9BQ9NP90 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
RAB9BQ9NP90 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RAB9BQ9NP90 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAB9BQ9NP90 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAB9BQ9NP90 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
RAB9BQ9NP90 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RAB9BQ9NP90 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RAB9BQ9NP90 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RAB9BQ9NP90 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAB9BQ9NP90 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAB9BQ9NP90 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAB9BQ9NP90 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RAB9BQ9NP90 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAB9BQ9NP90 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAB9BQ9NP90 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAB9BQ9NP90 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAB9BQ9NP90 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAB9BQ9NP90 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RAB9BQ9NP90 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RAB9BQ9NP90 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAB9BQ9NP90 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAB9BQ9NP90 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAB9BQ9NP90 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAB9BQ9NP90 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAB9BQ9NP90 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAB9BQ9NP90 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB9BQ9NP90 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB9BQ9NP90 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB9BQ9NP90 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB9BQ9NP90 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAB9BQ9NP90 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RAB9BQ9NP90 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAB9BQ9NP90 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
RAB9BQ9NP90 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAB9BQ9NP90 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAB9BQ9NP90 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAB9BQ9NP90 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAB9BQ9NP90 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAB9BQ9NP90 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RAB9BQ9NP90 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAB9BQ9NP90 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAB9BQ9NP90 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAB9BQ9NP90 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAB9BQ9NP90 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RAB9BQ9NP90 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAB9BQ9NP90 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAB9BQ9NP90 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAB9BQ9NP90 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAB9BQ9NP90 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAB9BQ9NP90 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAB9BQ9NP90 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAB9BQ9NP90 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAB9BQ9NP90 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAB9BQ9NP90 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAB9BQ9NP90 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAB9BQ9NP90 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAB9BQ9NP90 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAB9BQ9NP90 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAB9BQ9NP90 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAB9BQ9NP90 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAB9BQ9NP90 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAB9BQ9NP90 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAB9BQ9NP90 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAB9BQ9NP90 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAB9BQ9NP90 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAB9BQ9NP90 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAB9BQ9NP90 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAB9BQ9NP90 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAB9BQ9NP90 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAB9BQ9NP90 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RAB9BQ9NP90 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RAB9BQ9NP90 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RAB9BQ9NP90 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RAB9BQ9NP90 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAB9BQ9NP90 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAB9BQ9NP90 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAB9BQ9NP90 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAB9BQ9NP90 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAB9BQ9NP90 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAB9BQ9NP90 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAB9BQ9NP90 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAB9BQ9NP90 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAB9BQ9NP90 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAB9BQ9NP90 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAB9BQ9NP90 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAB9BQ9NP90 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAB9BQ9NP90 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAB9BQ9NP90 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAB9BQ9NP90 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAB9BQ9NP90 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAB9BQ9NP90 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAB9BQ9NP90 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAB9BQ9NP90 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAB9BQ9NP90 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAB9BQ9NP90 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms