Protein–RNA interactions for Protein: Q9NNX9

VCX3A, Variable charge X-linked protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCX3AQ9NNX9 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
VCX3AQ9NNX9 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
VCX3AQ9NNX9 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
VCX3AQ9NNX9 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
VCX3AQ9NNX9 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
VCX3AQ9NNX9 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
VCX3AQ9NNX9 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
VCX3AQ9NNX9 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
VCX3AQ9NNX9 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
VCX3AQ9NNX9 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
VCX3AQ9NNX9 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
VCX3AQ9NNX9 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
VCX3AQ9NNX9 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
VCX3AQ9NNX9 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
VCX3AQ9NNX9 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
VCX3AQ9NNX9 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
VCX3AQ9NNX9 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
VCX3AQ9NNX9 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
VCX3AQ9NNX9 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
VCX3AQ9NNX9 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
VCX3AQ9NNX9 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
VCX3AQ9NNX9 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
VCX3AQ9NNX9 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
VCX3AQ9NNX9 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
VCX3AQ9NNX9 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
VCX3AQ9NNX9 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
VCX3AQ9NNX9 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
VCX3AQ9NNX9 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
VCX3AQ9NNX9 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
VCX3AQ9NNX9 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
VCX3AQ9NNX9 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
VCX3AQ9NNX9 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
VCX3AQ9NNX9 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
VCX3AQ9NNX9 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
VCX3AQ9NNX9 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
VCX3AQ9NNX9 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
VCX3AQ9NNX9 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
VCX3AQ9NNX9 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
VCX3AQ9NNX9 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
VCX3AQ9NNX9 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
VCX3AQ9NNX9 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
VCX3AQ9NNX9 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
VCX3AQ9NNX9 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
VCX3AQ9NNX9 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
VCX3AQ9NNX9 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
VCX3AQ9NNX9 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
VCX3AQ9NNX9 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
VCX3AQ9NNX9 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
VCX3AQ9NNX9 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
VCX3AQ9NNX9 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
VCX3AQ9NNX9 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
VCX3AQ9NNX9 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
VCX3AQ9NNX9 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
VCX3AQ9NNX9 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
VCX3AQ9NNX9 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
VCX3AQ9NNX9 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
VCX3AQ9NNX9 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
VCX3AQ9NNX9 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
VCX3AQ9NNX9 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
VCX3AQ9NNX9 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
VCX3AQ9NNX9 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
VCX3AQ9NNX9 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
VCX3AQ9NNX9 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
VCX3AQ9NNX9 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
VCX3AQ9NNX9 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
VCX3AQ9NNX9 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
VCX3AQ9NNX9 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
VCX3AQ9NNX9 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
VCX3AQ9NNX9 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
VCX3AQ9NNX9 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
VCX3AQ9NNX9 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
VCX3AQ9NNX9 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
VCX3AQ9NNX9 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
VCX3AQ9NNX9 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
VCX3AQ9NNX9 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
VCX3AQ9NNX9 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
VCX3AQ9NNX9 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
VCX3AQ9NNX9 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
VCX3AQ9NNX9 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
VCX3AQ9NNX9 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
VCX3AQ9NNX9 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
VCX3AQ9NNX9 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
VCX3AQ9NNX9 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
VCX3AQ9NNX9 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
VCX3AQ9NNX9 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
VCX3AQ9NNX9 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
VCX3AQ9NNX9 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
VCX3AQ9NNX9 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
VCX3AQ9NNX9 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
VCX3AQ9NNX9 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
VCX3AQ9NNX9 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
VCX3AQ9NNX9 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
VCX3AQ9NNX9 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
VCX3AQ9NNX9 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
VCX3AQ9NNX9 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
VCX3AQ9NNX9 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
VCX3AQ9NNX9 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
VCX3AQ9NNX9 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
VCX3AQ9NNX9 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
VCX3AQ9NNX9 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.7 ms