Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2J4

PDCL3, Phosducin-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCL3Q9H2J4 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
PDCL3Q9H2J4 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
PDCL3Q9H2J4 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
PDCL3Q9H2J4 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
PDCL3Q9H2J4 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.7
PDCL3Q9H2J4 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC31.93■■■□□ 2.7
PDCL3Q9H2J4 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
PDCL3Q9H2J4 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
PDCL3Q9H2J4 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
PDCL3Q9H2J4 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
PDCL3Q9H2J4 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC31.86■■■□□ 2.69
PDCL3Q9H2J4 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
PDCL3Q9H2J4 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
PDCL3Q9H2J4 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC31.82■■■□□ 2.68
PDCL3Q9H2J4 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
PDCL3Q9H2J4 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC31.8■■■□□ 2.68
PDCL3Q9H2J4 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
PDCL3Q9H2J4 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
PDCL3Q9H2J4 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
PDCL3Q9H2J4 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
PDCL3Q9H2J4 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
PDCL3Q9H2J4 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
PDCL3Q9H2J4 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
PDCL3Q9H2J4 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
PDCL3Q9H2J4 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
PDCL3Q9H2J4 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
PDCL3Q9H2J4 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
PDCL3Q9H2J4 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
PDCL3Q9H2J4 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
PDCL3Q9H2J4 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
PDCL3Q9H2J4 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
PDCL3Q9H2J4 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
PDCL3Q9H2J4 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
PDCL3Q9H2J4 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
PDCL3Q9H2J4 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
PDCL3Q9H2J4 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
PDCL3Q9H2J4 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
PDCL3Q9H2J4 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
PDCL3Q9H2J4 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC31.43■■■□□ 2.62
PDCL3Q9H2J4 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
PDCL3Q9H2J4 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC31.42■■■□□ 2.62
PDCL3Q9H2J4 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
PDCL3Q9H2J4 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
PDCL3Q9H2J4 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
PDCL3Q9H2J4 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
PDCL3Q9H2J4 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
PDCL3Q9H2J4 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
PDCL3Q9H2J4 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
PDCL3Q9H2J4 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
PDCL3Q9H2J4 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
PDCL3Q9H2J4 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
PDCL3Q9H2J4 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
PDCL3Q9H2J4 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
PDCL3Q9H2J4 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
PDCL3Q9H2J4 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
PDCL3Q9H2J4 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
PDCL3Q9H2J4 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
PDCL3Q9H2J4 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
PDCL3Q9H2J4 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC31.24■■■□□ 2.59
PDCL3Q9H2J4 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC31.23■■■□□ 2.59
PDCL3Q9H2J4 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
PDCL3Q9H2J4 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
PDCL3Q9H2J4 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
PDCL3Q9H2J4 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
PDCL3Q9H2J4 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
PDCL3Q9H2J4 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
PDCL3Q9H2J4 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
PDCL3Q9H2J4 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
PDCL3Q9H2J4 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
PDCL3Q9H2J4 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.58
PDCL3Q9H2J4 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.57
PDCL3Q9H2J4 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
PDCL3Q9H2J4 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
PDCL3Q9H2J4 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
PDCL3Q9H2J4 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
PDCL3Q9H2J4 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
PDCL3Q9H2J4 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
PDCL3Q9H2J4 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
PDCL3Q9H2J4 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
PDCL3Q9H2J4 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
PDCL3Q9H2J4 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
PDCL3Q9H2J4 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
PDCL3Q9H2J4 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC30.99■■■□□ 2.55
PDCL3Q9H2J4 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
PDCL3Q9H2J4 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC30.97■■■□□ 2.55
PDCL3Q9H2J4 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
PDCL3Q9H2J4 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
PDCL3Q9H2J4 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
PDCL3Q9H2J4 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
PDCL3Q9H2J4 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
PDCL3Q9H2J4 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
PDCL3Q9H2J4 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
PDCL3Q9H2J4 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
PDCL3Q9H2J4 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
PDCL3Q9H2J4 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
PDCL3Q9H2J4 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
PDCL3Q9H2J4 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
PDCL3Q9H2J4 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
PDCL3Q9H2J4 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
PDCL3Q9H2J4 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.7 ms