Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXM7

PINK1, Serine/threonine-protein kinase PINK1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PINK1Q9BXM7 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PINK1Q9BXM7 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PINK1Q9BXM7 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PINK1Q9BXM7 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PINK1Q9BXM7 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PINK1Q9BXM7 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PINK1Q9BXM7 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PINK1Q9BXM7 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PINK1Q9BXM7 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PINK1Q9BXM7 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
PINK1Q9BXM7 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PINK1Q9BXM7 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PINK1Q9BXM7 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PINK1Q9BXM7 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PINK1Q9BXM7 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PINK1Q9BXM7 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PINK1Q9BXM7 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PINK1Q9BXM7 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PINK1Q9BXM7 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PINK1Q9BXM7 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PINK1Q9BXM7 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PINK1Q9BXM7 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PINK1Q9BXM7 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PINK1Q9BXM7 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PINK1Q9BXM7 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PINK1Q9BXM7 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PINK1Q9BXM7 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PINK1Q9BXM7 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PINK1Q9BXM7 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PINK1Q9BXM7 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PINK1Q9BXM7 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PINK1Q9BXM7 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PINK1Q9BXM7 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PINK1Q9BXM7 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PINK1Q9BXM7 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PINK1Q9BXM7 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PINK1Q9BXM7 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PINK1Q9BXM7 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PINK1Q9BXM7 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PINK1Q9BXM7 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PINK1Q9BXM7 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PINK1Q9BXM7 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PINK1Q9BXM7 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PINK1Q9BXM7 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PINK1Q9BXM7 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PINK1Q9BXM7 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PINK1Q9BXM7 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PINK1Q9BXM7 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PINK1Q9BXM7 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PINK1Q9BXM7 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PINK1Q9BXM7 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
PINK1Q9BXM7 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PINK1Q9BXM7 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PINK1Q9BXM7 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PINK1Q9BXM7 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PINK1Q9BXM7 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PINK1Q9BXM7 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PINK1Q9BXM7 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PINK1Q9BXM7 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PINK1Q9BXM7 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PINK1Q9BXM7 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PINK1Q9BXM7 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PINK1Q9BXM7 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PINK1Q9BXM7 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PINK1Q9BXM7 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PINK1Q9BXM7 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PINK1Q9BXM7 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PINK1Q9BXM7 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PINK1Q9BXM7 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PINK1Q9BXM7 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PINK1Q9BXM7 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PINK1Q9BXM7 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PINK1Q9BXM7 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PINK1Q9BXM7 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PINK1Q9BXM7 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PINK1Q9BXM7 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PINK1Q9BXM7 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PINK1Q9BXM7 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PINK1Q9BXM7 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PINK1Q9BXM7 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PINK1Q9BXM7 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
PINK1Q9BXM7 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PINK1Q9BXM7 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PINK1Q9BXM7 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PINK1Q9BXM7 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PINK1Q9BXM7 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PINK1Q9BXM7 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PINK1Q9BXM7 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PINK1Q9BXM7 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PINK1Q9BXM7 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PINK1Q9BXM7 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PINK1Q9BXM7 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
PINK1Q9BXM7 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PINK1Q9BXM7 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PINK1Q9BXM7 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PINK1Q9BXM7 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PINK1Q9BXM7 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PINK1Q9BXM7 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PINK1Q9BXM7 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PINK1Q9BXM7 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89 ms