Protein–RNA interactions for Protein: Q99909

SSX3, Protein SSX3, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX3Q99909 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SSX3Q99909 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SSX3Q99909 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SSX3Q99909 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SSX3Q99909 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SSX3Q99909 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SSX3Q99909 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SSX3Q99909 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SSX3Q99909 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SSX3Q99909 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SSX3Q99909 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SSX3Q99909 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SSX3Q99909 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SSX3Q99909 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SSX3Q99909 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SSX3Q99909 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SSX3Q99909 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SSX3Q99909 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SSX3Q99909 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SSX3Q99909 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SSX3Q99909 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SSX3Q99909 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SSX3Q99909 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SSX3Q99909 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SSX3Q99909 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SSX3Q99909 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SSX3Q99909 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SSX3Q99909 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SSX3Q99909 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SSX3Q99909 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SSX3Q99909 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SSX3Q99909 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SSX3Q99909 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SSX3Q99909 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SSX3Q99909 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SSX3Q99909 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SSX3Q99909 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SSX3Q99909 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SSX3Q99909 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SSX3Q99909 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SSX3Q99909 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SSX3Q99909 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SSX3Q99909 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SSX3Q99909 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SSX3Q99909 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SSX3Q99909 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SSX3Q99909 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SSX3Q99909 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SSX3Q99909 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SSX3Q99909 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SSX3Q99909 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SSX3Q99909 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SSX3Q99909 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SSX3Q99909 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SSX3Q99909 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SSX3Q99909 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SSX3Q99909 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SSX3Q99909 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SSX3Q99909 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SSX3Q99909 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SSX3Q99909 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SSX3Q99909 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SSX3Q99909 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SSX3Q99909 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SSX3Q99909 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SSX3Q99909 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SSX3Q99909 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SSX3Q99909 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SSX3Q99909 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SSX3Q99909 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SSX3Q99909 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SSX3Q99909 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SSX3Q99909 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SSX3Q99909 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SSX3Q99909 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SSX3Q99909 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SSX3Q99909 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SSX3Q99909 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SSX3Q99909 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SSX3Q99909 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SSX3Q99909 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SSX3Q99909 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SSX3Q99909 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SSX3Q99909 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SSX3Q99909 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SSX3Q99909 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SSX3Q99909 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SSX3Q99909 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SSX3Q99909 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SSX3Q99909 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SSX3Q99909 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SSX3Q99909 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SSX3Q99909 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SSX3Q99909 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SSX3Q99909 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SSX3Q99909 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SSX3Q99909 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SSX3Q99909 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SSX3Q99909 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SSX3Q99909 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms