Protein–RNA interactions for Protein: Q99417

MYCBP, c-Myc-binding protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYCBPQ99417 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
MYCBPQ99417 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
MYCBPQ99417 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
MYCBPQ99417 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
MYCBPQ99417 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
MYCBPQ99417 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
MYCBPQ99417 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
MYCBPQ99417 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
MYCBPQ99417 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
MYCBPQ99417 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
MYCBPQ99417 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
MYCBPQ99417 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
MYCBPQ99417 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
MYCBPQ99417 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
MYCBPQ99417 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
MYCBPQ99417 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
MYCBPQ99417 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
MYCBPQ99417 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
MYCBPQ99417 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
MYCBPQ99417 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
MYCBPQ99417 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
MYCBPQ99417 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
MYCBPQ99417 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
MYCBPQ99417 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
MYCBPQ99417 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
MYCBPQ99417 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
MYCBPQ99417 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
MYCBPQ99417 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
MYCBPQ99417 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
MYCBPQ99417 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
MYCBPQ99417 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
MYCBPQ99417 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
MYCBPQ99417 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
MYCBPQ99417 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
MYCBPQ99417 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
MYCBPQ99417 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
MYCBPQ99417 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
MYCBPQ99417 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
MYCBPQ99417 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
MYCBPQ99417 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
MYCBPQ99417 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
MYCBPQ99417 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
MYCBPQ99417 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
MYCBPQ99417 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
MYCBPQ99417 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
MYCBPQ99417 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
MYCBPQ99417 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
MYCBPQ99417 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
MYCBPQ99417 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
MYCBPQ99417 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
MYCBPQ99417 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
MYCBPQ99417 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
MYCBPQ99417 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
MYCBPQ99417 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
MYCBPQ99417 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
MYCBPQ99417 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
MYCBPQ99417 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
MYCBPQ99417 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
MYCBPQ99417 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
MYCBPQ99417 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
MYCBPQ99417 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
MYCBPQ99417 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
MYCBPQ99417 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
MYCBPQ99417 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
MYCBPQ99417 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
MYCBPQ99417 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
MYCBPQ99417 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
MYCBPQ99417 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
MYCBPQ99417 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
MYCBPQ99417 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
MYCBPQ99417 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
MYCBPQ99417 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
MYCBPQ99417 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
MYCBPQ99417 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
MYCBPQ99417 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
MYCBPQ99417 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
MYCBPQ99417 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
MYCBPQ99417 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
MYCBPQ99417 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MYCBPQ99417 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
MYCBPQ99417 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
MYCBPQ99417 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MYCBPQ99417 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
MYCBPQ99417 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MYCBPQ99417 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
MYCBPQ99417 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
MYCBPQ99417 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MYCBPQ99417 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
MYCBPQ99417 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
MYCBPQ99417 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
MYCBPQ99417 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
MYCBPQ99417 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
MYCBPQ99417 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
MYCBPQ99417 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MYCBPQ99417 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MYCBPQ99417 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MYCBPQ99417 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
MYCBPQ99417 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MYCBPQ99417 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
MYCBPQ99417 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms