Protein–RNA interactions for Protein: Q96FV0

LRRC46, Leucine-rich repeat-containing protein 46, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC46Q96FV0 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
LRRC46Q96FV0 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LRRC46Q96FV0 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LRRC46Q96FV0 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LRRC46Q96FV0 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LRRC46Q96FV0 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LRRC46Q96FV0 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LRRC46Q96FV0 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LRRC46Q96FV0 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LRRC46Q96FV0 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LRRC46Q96FV0 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRRC46Q96FV0 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRRC46Q96FV0 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
LRRC46Q96FV0 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LRRC46Q96FV0 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
LRRC46Q96FV0 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LRRC46Q96FV0 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LRRC46Q96FV0 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LRRC46Q96FV0 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
LRRC46Q96FV0 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LRRC46Q96FV0 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LRRC46Q96FV0 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LRRC46Q96FV0 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LRRC46Q96FV0 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LRRC46Q96FV0 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LRRC46Q96FV0 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LRRC46Q96FV0 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LRRC46Q96FV0 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRRC46Q96FV0 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRC46Q96FV0 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
LRRC46Q96FV0 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LRRC46Q96FV0 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRRC46Q96FV0 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRRC46Q96FV0 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRRC46Q96FV0 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRRC46Q96FV0 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRRC46Q96FV0 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRRC46Q96FV0 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRC46Q96FV0 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRC46Q96FV0 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LRRC46Q96FV0 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
LRRC46Q96FV0 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRRC46Q96FV0 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRRC46Q96FV0 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRRC46Q96FV0 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRRC46Q96FV0 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRRC46Q96FV0 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRRC46Q96FV0 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRRC46Q96FV0 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRRC46Q96FV0 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRRC46Q96FV0 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRRC46Q96FV0 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRRC46Q96FV0 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRRC46Q96FV0 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRRC46Q96FV0 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LRRC46Q96FV0 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRRC46Q96FV0 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRRC46Q96FV0 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRRC46Q96FV0 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRRC46Q96FV0 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRRC46Q96FV0 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LRRC46Q96FV0 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
LRRC46Q96FV0 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LRRC46Q96FV0 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
LRRC46Q96FV0 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRRC46Q96FV0 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRRC46Q96FV0 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRRC46Q96FV0 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRRC46Q96FV0 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRRC46Q96FV0 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRRC46Q96FV0 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRRC46Q96FV0 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LRRC46Q96FV0 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LRRC46Q96FV0 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LRRC46Q96FV0 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRRC46Q96FV0 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRRC46Q96FV0 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LRRC46Q96FV0 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRRC46Q96FV0 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRRC46Q96FV0 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRRC46Q96FV0 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
LRRC46Q96FV0 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRRC46Q96FV0 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRRC46Q96FV0 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
LRRC46Q96FV0 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRRC46Q96FV0 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRRC46Q96FV0 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRRC46Q96FV0 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRRC46Q96FV0 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRRC46Q96FV0 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRRC46Q96FV0 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRRC46Q96FV0 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LRRC46Q96FV0 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LRRC46Q96FV0 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LRRC46Q96FV0 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRRC46Q96FV0 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRRC46Q96FV0 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRRC46Q96FV0 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRRC46Q96FV0 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LRRC46Q96FV0 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 213.9 ms