Protein–RNA interactions for Protein: Q96DB5

RMDN1, Regulator of microtubule dynamics protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RMDN1Q96DB5 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
RMDN1Q96DB5 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
RMDN1Q96DB5 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
RMDN1Q96DB5 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
RMDN1Q96DB5 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
RMDN1Q96DB5 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
RMDN1Q96DB5 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
RMDN1Q96DB5 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
RMDN1Q96DB5 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
RMDN1Q96DB5 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
RMDN1Q96DB5 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
RMDN1Q96DB5 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
RMDN1Q96DB5 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
RMDN1Q96DB5 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC29.73■■■□□ 2.35
RMDN1Q96DB5 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
RMDN1Q96DB5 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
RMDN1Q96DB5 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
RMDN1Q96DB5 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
RMDN1Q96DB5 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
RMDN1Q96DB5 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
RMDN1Q96DB5 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
RMDN1Q96DB5 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
RMDN1Q96DB5 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
RMDN1Q96DB5 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
RMDN1Q96DB5 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
RMDN1Q96DB5 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
RMDN1Q96DB5 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
RMDN1Q96DB5 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
RMDN1Q96DB5 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
RMDN1Q96DB5 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
RMDN1Q96DB5 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
RMDN1Q96DB5 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
RMDN1Q96DB5 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
RMDN1Q96DB5 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
RMDN1Q96DB5 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
RMDN1Q96DB5 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
RMDN1Q96DB5 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
RMDN1Q96DB5 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
RMDN1Q96DB5 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
RMDN1Q96DB5 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
RMDN1Q96DB5 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
RMDN1Q96DB5 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
RMDN1Q96DB5 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
RMDN1Q96DB5 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
RMDN1Q96DB5 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
RMDN1Q96DB5 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
RMDN1Q96DB5 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
RMDN1Q96DB5 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
RMDN1Q96DB5 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
RMDN1Q96DB5 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
RMDN1Q96DB5 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
RMDN1Q96DB5 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
RMDN1Q96DB5 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
RMDN1Q96DB5 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
RMDN1Q96DB5 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
RMDN1Q96DB5 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
RMDN1Q96DB5 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
RMDN1Q96DB5 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
RMDN1Q96DB5 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
RMDN1Q96DB5 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
RMDN1Q96DB5 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC29.11■■■□□ 2.25
RMDN1Q96DB5 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
RMDN1Q96DB5 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
RMDN1Q96DB5 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
RMDN1Q96DB5 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
RMDN1Q96DB5 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
RMDN1Q96DB5 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
RMDN1Q96DB5 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
RMDN1Q96DB5 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
RMDN1Q96DB5 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
RMDN1Q96DB5 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
RMDN1Q96DB5 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
RMDN1Q96DB5 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
RMDN1Q96DB5 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.22
RMDN1Q96DB5 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
RMDN1Q96DB5 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RMDN1Q96DB5 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RMDN1Q96DB5 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
RMDN1Q96DB5 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
RMDN1Q96DB5 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
RMDN1Q96DB5 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
RMDN1Q96DB5 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RMDN1Q96DB5 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RMDN1Q96DB5 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RMDN1Q96DB5 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RMDN1Q96DB5 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
RMDN1Q96DB5 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RMDN1Q96DB5 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
RMDN1Q96DB5 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RMDN1Q96DB5 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RMDN1Q96DB5 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RMDN1Q96DB5 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
RMDN1Q96DB5 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RMDN1Q96DB5 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
RMDN1Q96DB5 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
RMDN1Q96DB5 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RMDN1Q96DB5 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
RMDN1Q96DB5 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
RMDN1Q96DB5 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
RMDN1Q96DB5 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9 ms