Protein–RNA interactions for Protein: Q8TF42

UBASH3B, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, humanhuman

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Length 649 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3BQ8TF42 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
UBASH3BQ8TF42 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
UBASH3BQ8TF42 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
UBASH3BQ8TF42 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
UBASH3BQ8TF42 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
UBASH3BQ8TF42 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
UBASH3BQ8TF42 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
UBASH3BQ8TF42 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
UBASH3BQ8TF42 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
UBASH3BQ8TF42 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
UBASH3BQ8TF42 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
UBASH3BQ8TF42 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
UBASH3BQ8TF42 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
UBASH3BQ8TF42 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
UBASH3BQ8TF42 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
UBASH3BQ8TF42 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
UBASH3BQ8TF42 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
UBASH3BQ8TF42 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
UBASH3BQ8TF42 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
UBASH3BQ8TF42 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
UBASH3BQ8TF42 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
UBASH3BQ8TF42 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
UBASH3BQ8TF42 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
UBASH3BQ8TF42 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
UBASH3BQ8TF42 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
UBASH3BQ8TF42 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
UBASH3BQ8TF42 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
UBASH3BQ8TF42 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
UBASH3BQ8TF42 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
UBASH3BQ8TF42 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
UBASH3BQ8TF42 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
UBASH3BQ8TF42 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
UBASH3BQ8TF42 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
UBASH3BQ8TF42 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
UBASH3BQ8TF42 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
UBASH3BQ8TF42 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
UBASH3BQ8TF42 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
UBASH3BQ8TF42 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
UBASH3BQ8TF42 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
UBASH3BQ8TF42 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
UBASH3BQ8TF42 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
UBASH3BQ8TF42 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
UBASH3BQ8TF42 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
UBASH3BQ8TF42 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
UBASH3BQ8TF42 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
UBASH3BQ8TF42 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
UBASH3BQ8TF42 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
UBASH3BQ8TF42 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
UBASH3BQ8TF42 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
UBASH3BQ8TF42 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
UBASH3BQ8TF42 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
UBASH3BQ8TF42 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
UBASH3BQ8TF42 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
UBASH3BQ8TF42 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
UBASH3BQ8TF42 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
UBASH3BQ8TF42 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
UBASH3BQ8TF42 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
UBASH3BQ8TF42 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
UBASH3BQ8TF42 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
UBASH3BQ8TF42 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
UBASH3BQ8TF42 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
UBASH3BQ8TF42 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
UBASH3BQ8TF42 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
UBASH3BQ8TF42 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
UBASH3BQ8TF42 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
UBASH3BQ8TF42 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
UBASH3BQ8TF42 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
UBASH3BQ8TF42 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
UBASH3BQ8TF42 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
UBASH3BQ8TF42 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
UBASH3BQ8TF42 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
UBASH3BQ8TF42 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
UBASH3BQ8TF42 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
UBASH3BQ8TF42 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
UBASH3BQ8TF42 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
UBASH3BQ8TF42 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
UBASH3BQ8TF42 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
UBASH3BQ8TF42 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
UBASH3BQ8TF42 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
UBASH3BQ8TF42 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
UBASH3BQ8TF42 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
UBASH3BQ8TF42 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
UBASH3BQ8TF42 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
UBASH3BQ8TF42 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
UBASH3BQ8TF42 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
UBASH3BQ8TF42 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
UBASH3BQ8TF42 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
UBASH3BQ8TF42 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
UBASH3BQ8TF42 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
UBASH3BQ8TF42 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
UBASH3BQ8TF42 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
UBASH3BQ8TF42 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
UBASH3BQ8TF42 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
UBASH3BQ8TF42 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
UBASH3BQ8TF42 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
UBASH3BQ8TF42 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
UBASH3BQ8TF42 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
UBASH3BQ8TF42 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
UBASH3BQ8TF42 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
UBASH3BQ8TF42 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
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