Protein–RNA interactions for Protein: Q8N7B6

PACRGL, PACRG-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACRGLQ8N7B6 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PACRGLQ8N7B6 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PACRGLQ8N7B6 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PACRGLQ8N7B6 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PACRGLQ8N7B6 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PACRGLQ8N7B6 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PACRGLQ8N7B6 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PACRGLQ8N7B6 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PACRGLQ8N7B6 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PACRGLQ8N7B6 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PACRGLQ8N7B6 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PACRGLQ8N7B6 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PACRGLQ8N7B6 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PACRGLQ8N7B6 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PACRGLQ8N7B6 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PACRGLQ8N7B6 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PACRGLQ8N7B6 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PACRGLQ8N7B6 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PACRGLQ8N7B6 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PACRGLQ8N7B6 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
PACRGLQ8N7B6 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PACRGLQ8N7B6 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PACRGLQ8N7B6 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PACRGLQ8N7B6 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PACRGLQ8N7B6 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PACRGLQ8N7B6 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PACRGLQ8N7B6 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PACRGLQ8N7B6 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PACRGLQ8N7B6 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PACRGLQ8N7B6 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PACRGLQ8N7B6 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PACRGLQ8N7B6 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PACRGLQ8N7B6 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PACRGLQ8N7B6 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PACRGLQ8N7B6 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PACRGLQ8N7B6 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PACRGLQ8N7B6 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PACRGLQ8N7B6 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PACRGLQ8N7B6 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PACRGLQ8N7B6 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PACRGLQ8N7B6 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PACRGLQ8N7B6 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PACRGLQ8N7B6 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PACRGLQ8N7B6 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PACRGLQ8N7B6 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PACRGLQ8N7B6 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.84
PACRGLQ8N7B6 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PACRGLQ8N7B6 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PACRGLQ8N7B6 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PACRGLQ8N7B6 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PACRGLQ8N7B6 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PACRGLQ8N7B6 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PACRGLQ8N7B6 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PACRGLQ8N7B6 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PACRGLQ8N7B6 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PACRGLQ8N7B6 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PACRGLQ8N7B6 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PACRGLQ8N7B6 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PACRGLQ8N7B6 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PACRGLQ8N7B6 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PACRGLQ8N7B6 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PACRGLQ8N7B6 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PACRGLQ8N7B6 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PACRGLQ8N7B6 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PACRGLQ8N7B6 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PACRGLQ8N7B6 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PACRGLQ8N7B6 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PACRGLQ8N7B6 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PACRGLQ8N7B6 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PACRGLQ8N7B6 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
PACRGLQ8N7B6 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PACRGLQ8N7B6 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PACRGLQ8N7B6 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PACRGLQ8N7B6 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PACRGLQ8N7B6 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PACRGLQ8N7B6 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PACRGLQ8N7B6 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PACRGLQ8N7B6 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PACRGLQ8N7B6 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PACRGLQ8N7B6 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PACRGLQ8N7B6 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PACRGLQ8N7B6 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PACRGLQ8N7B6 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PACRGLQ8N7B6 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PACRGLQ8N7B6 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PACRGLQ8N7B6 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PACRGLQ8N7B6 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PACRGLQ8N7B6 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PACRGLQ8N7B6 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PACRGLQ8N7B6 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PACRGLQ8N7B6 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PACRGLQ8N7B6 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PACRGLQ8N7B6 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PACRGLQ8N7B6 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PACRGLQ8N7B6 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PACRGLQ8N7B6 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PACRGLQ8N7B6 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PACRGLQ8N7B6 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PACRGLQ8N7B6 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PACRGLQ8N7B6 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms