Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3B0

SMIM15, Small integral membrane protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 74 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM15Q7Z3B0 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMIM15Q7Z3B0 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMIM15Q7Z3B0 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMIM15Q7Z3B0 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SMIM15Q7Z3B0 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMIM15Q7Z3B0 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMIM15Q7Z3B0 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMIM15Q7Z3B0 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMIM15Q7Z3B0 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMIM15Q7Z3B0 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMIM15Q7Z3B0 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMIM15Q7Z3B0 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMIM15Q7Z3B0 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMIM15Q7Z3B0 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMIM15Q7Z3B0 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMIM15Q7Z3B0 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMIM15Q7Z3B0 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMIM15Q7Z3B0 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMIM15Q7Z3B0 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMIM15Q7Z3B0 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMIM15Q7Z3B0 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMIM15Q7Z3B0 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMIM15Q7Z3B0 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SMIM15Q7Z3B0 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SMIM15Q7Z3B0 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMIM15Q7Z3B0 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMIM15Q7Z3B0 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMIM15Q7Z3B0 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMIM15Q7Z3B0 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SMIM15Q7Z3B0 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SMIM15Q7Z3B0 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SMIM15Q7Z3B0 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SMIM15Q7Z3B0 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SMIM15Q7Z3B0 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SMIM15Q7Z3B0 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SMIM15Q7Z3B0 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SMIM15Q7Z3B0 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SMIM15Q7Z3B0 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SMIM15Q7Z3B0 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SMIM15Q7Z3B0 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SMIM15Q7Z3B0 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SMIM15Q7Z3B0 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SMIM15Q7Z3B0 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SMIM15Q7Z3B0 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SMIM15Q7Z3B0 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMIM15Q7Z3B0 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMIM15Q7Z3B0 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMIM15Q7Z3B0 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMIM15Q7Z3B0 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SMIM15Q7Z3B0 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMIM15Q7Z3B0 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMIM15Q7Z3B0 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMIM15Q7Z3B0 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMIM15Q7Z3B0 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMIM15Q7Z3B0 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SMIM15Q7Z3B0 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SMIM15Q7Z3B0 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMIM15Q7Z3B0 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SMIM15Q7Z3B0 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SMIM15Q7Z3B0 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SMIM15Q7Z3B0 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
SMIM15Q7Z3B0 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SMIM15Q7Z3B0 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SMIM15Q7Z3B0 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SMIM15Q7Z3B0 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SMIM15Q7Z3B0 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SMIM15Q7Z3B0 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SMIM15Q7Z3B0 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SMIM15Q7Z3B0 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SMIM15Q7Z3B0 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
SMIM15Q7Z3B0 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.95
SMIM15Q7Z3B0 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SMIM15Q7Z3B0 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SMIM15Q7Z3B0 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SMIM15Q7Z3B0 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SMIM15Q7Z3B0 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SMIM15Q7Z3B0 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SMIM15Q7Z3B0 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SMIM15Q7Z3B0 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SMIM15Q7Z3B0 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SMIM15Q7Z3B0 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SMIM15Q7Z3B0 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SMIM15Q7Z3B0 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SMIM15Q7Z3B0 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SMIM15Q7Z3B0 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SMIM15Q7Z3B0 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SMIM15Q7Z3B0 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SMIM15Q7Z3B0 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SMIM15Q7Z3B0 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SMIM15Q7Z3B0 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SMIM15Q7Z3B0 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SMIM15Q7Z3B0 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SMIM15Q7Z3B0 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SMIM15Q7Z3B0 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SMIM15Q7Z3B0 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SMIM15Q7Z3B0 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SMIM15Q7Z3B0 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SMIM15Q7Z3B0 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SMIM15Q7Z3B0 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SMIM15Q7Z3B0 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.7 ms