Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWI9

RFPL4B, Ret finger protein-like 4B, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFPL4BQ6ZWI9 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RFPL4BQ6ZWI9 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RFPL4BQ6ZWI9 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RFPL4BQ6ZWI9 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RFPL4BQ6ZWI9 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RFPL4BQ6ZWI9 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RFPL4BQ6ZWI9 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
RFPL4BQ6ZWI9 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RFPL4BQ6ZWI9 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RFPL4BQ6ZWI9 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
RFPL4BQ6ZWI9 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RFPL4BQ6ZWI9 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RFPL4BQ6ZWI9 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RFPL4BQ6ZWI9 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RFPL4BQ6ZWI9 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RFPL4BQ6ZWI9 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RFPL4BQ6ZWI9 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
RFPL4BQ6ZWI9 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RFPL4BQ6ZWI9 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RFPL4BQ6ZWI9 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RFPL4BQ6ZWI9 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
RFPL4BQ6ZWI9 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RFPL4BQ6ZWI9 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RFPL4BQ6ZWI9 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RFPL4BQ6ZWI9 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RFPL4BQ6ZWI9 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RFPL4BQ6ZWI9 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RFPL4BQ6ZWI9 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RFPL4BQ6ZWI9 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RFPL4BQ6ZWI9 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RFPL4BQ6ZWI9 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RFPL4BQ6ZWI9 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
RFPL4BQ6ZWI9 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RFPL4BQ6ZWI9 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RFPL4BQ6ZWI9 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RFPL4BQ6ZWI9 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RFPL4BQ6ZWI9 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RFPL4BQ6ZWI9 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RFPL4BQ6ZWI9 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RFPL4BQ6ZWI9 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RFPL4BQ6ZWI9 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RFPL4BQ6ZWI9 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RFPL4BQ6ZWI9 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RFPL4BQ6ZWI9 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RFPL4BQ6ZWI9 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RFPL4BQ6ZWI9 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RFPL4BQ6ZWI9 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RFPL4BQ6ZWI9 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RFPL4BQ6ZWI9 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RFPL4BQ6ZWI9 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
RFPL4BQ6ZWI9 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RFPL4BQ6ZWI9 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RFPL4BQ6ZWI9 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RFPL4BQ6ZWI9 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RFPL4BQ6ZWI9 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RFPL4BQ6ZWI9 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RFPL4BQ6ZWI9 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RFPL4BQ6ZWI9 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RFPL4BQ6ZWI9 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RFPL4BQ6ZWI9 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RFPL4BQ6ZWI9 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RFPL4BQ6ZWI9 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RFPL4BQ6ZWI9 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RFPL4BQ6ZWI9 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RFPL4BQ6ZWI9 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RFPL4BQ6ZWI9 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RFPL4BQ6ZWI9 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RFPL4BQ6ZWI9 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RFPL4BQ6ZWI9 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
RFPL4BQ6ZWI9 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RFPL4BQ6ZWI9 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RFPL4BQ6ZWI9 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
RFPL4BQ6ZWI9 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RFPL4BQ6ZWI9 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RFPL4BQ6ZWI9 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RFPL4BQ6ZWI9 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RFPL4BQ6ZWI9 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RFPL4BQ6ZWI9 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RFPL4BQ6ZWI9 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RFPL4BQ6ZWI9 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RFPL4BQ6ZWI9 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RFPL4BQ6ZWI9 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RFPL4BQ6ZWI9 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RFPL4BQ6ZWI9 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RFPL4BQ6ZWI9 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RFPL4BQ6ZWI9 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RFPL4BQ6ZWI9 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RFPL4BQ6ZWI9 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RFPL4BQ6ZWI9 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RFPL4BQ6ZWI9 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RFPL4BQ6ZWI9 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RFPL4BQ6ZWI9 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RFPL4BQ6ZWI9 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RFPL4BQ6ZWI9 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RFPL4BQ6ZWI9 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RFPL4BQ6ZWI9 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RFPL4BQ6ZWI9 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RFPL4BQ6ZWI9 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RFPL4BQ6ZWI9 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RFPL4BQ6ZWI9 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.5 ms