Protein–RNA interactions for Protein: Q6VUC0

TFAP2E, Transcription factor AP-2-epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAP2EQ6VUC0 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TFAP2EQ6VUC0 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TFAP2EQ6VUC0 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TFAP2EQ6VUC0 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TFAP2EQ6VUC0 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TFAP2EQ6VUC0 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TFAP2EQ6VUC0 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TFAP2EQ6VUC0 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TFAP2EQ6VUC0 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TFAP2EQ6VUC0 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TFAP2EQ6VUC0 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
TFAP2EQ6VUC0 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TFAP2EQ6VUC0 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TFAP2EQ6VUC0 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TFAP2EQ6VUC0 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TFAP2EQ6VUC0 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TFAP2EQ6VUC0 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TFAP2EQ6VUC0 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TFAP2EQ6VUC0 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TFAP2EQ6VUC0 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TFAP2EQ6VUC0 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TFAP2EQ6VUC0 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
TFAP2EQ6VUC0 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TFAP2EQ6VUC0 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TFAP2EQ6VUC0 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TFAP2EQ6VUC0 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TFAP2EQ6VUC0 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TFAP2EQ6VUC0 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TFAP2EQ6VUC0 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TFAP2EQ6VUC0 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TFAP2EQ6VUC0 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TFAP2EQ6VUC0 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
TFAP2EQ6VUC0 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TFAP2EQ6VUC0 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TFAP2EQ6VUC0 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TFAP2EQ6VUC0 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TFAP2EQ6VUC0 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TFAP2EQ6VUC0 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TFAP2EQ6VUC0 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TFAP2EQ6VUC0 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TFAP2EQ6VUC0 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TFAP2EQ6VUC0 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TFAP2EQ6VUC0 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TFAP2EQ6VUC0 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TFAP2EQ6VUC0 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TFAP2EQ6VUC0 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TFAP2EQ6VUC0 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TFAP2EQ6VUC0 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TFAP2EQ6VUC0 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TFAP2EQ6VUC0 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TFAP2EQ6VUC0 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TFAP2EQ6VUC0 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TFAP2EQ6VUC0 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TFAP2EQ6VUC0 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TFAP2EQ6VUC0 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TFAP2EQ6VUC0 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TFAP2EQ6VUC0 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TFAP2EQ6VUC0 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TFAP2EQ6VUC0 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TFAP2EQ6VUC0 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TFAP2EQ6VUC0 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TFAP2EQ6VUC0 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TFAP2EQ6VUC0 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TFAP2EQ6VUC0 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TFAP2EQ6VUC0 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TFAP2EQ6VUC0 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TFAP2EQ6VUC0 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TFAP2EQ6VUC0 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TFAP2EQ6VUC0 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TFAP2EQ6VUC0 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TFAP2EQ6VUC0 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TFAP2EQ6VUC0 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TFAP2EQ6VUC0 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TFAP2EQ6VUC0 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TFAP2EQ6VUC0 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TFAP2EQ6VUC0 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TFAP2EQ6VUC0 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
TFAP2EQ6VUC0 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TFAP2EQ6VUC0 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TFAP2EQ6VUC0 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TFAP2EQ6VUC0 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TFAP2EQ6VUC0 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TFAP2EQ6VUC0 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TFAP2EQ6VUC0 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TFAP2EQ6VUC0 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TFAP2EQ6VUC0 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TFAP2EQ6VUC0 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TFAP2EQ6VUC0 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TFAP2EQ6VUC0 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TFAP2EQ6VUC0 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TFAP2EQ6VUC0 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TFAP2EQ6VUC0 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TFAP2EQ6VUC0 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TFAP2EQ6VUC0 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TFAP2EQ6VUC0 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TFAP2EQ6VUC0 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TFAP2EQ6VUC0 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
TFAP2EQ6VUC0 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
TFAP2EQ6VUC0 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TFAP2EQ6VUC0 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.4 ms