Protein–RNA interactions for Protein: Q659A1

ICE2, Little elongation complex subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 982 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ICE2Q659A1 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
ICE2Q659A1 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
ICE2Q659A1 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
ICE2Q659A1 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
ICE2Q659A1 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
ICE2Q659A1 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ICE2Q659A1 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ICE2Q659A1 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
ICE2Q659A1 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ICE2Q659A1 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ICE2Q659A1 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
ICE2Q659A1 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
ICE2Q659A1 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ICE2Q659A1 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ICE2Q659A1 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ICE2Q659A1 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ICE2Q659A1 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
ICE2Q659A1 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ICE2Q659A1 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ICE2Q659A1 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ICE2Q659A1 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ICE2Q659A1 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ICE2Q659A1 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ICE2Q659A1 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
ICE2Q659A1 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ICE2Q659A1 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ICE2Q659A1 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ICE2Q659A1 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ICE2Q659A1 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
ICE2Q659A1 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
ICE2Q659A1 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
ICE2Q659A1 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ICE2Q659A1 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
ICE2Q659A1 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ICE2Q659A1 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ICE2Q659A1 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ICE2Q659A1 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ICE2Q659A1 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ICE2Q659A1 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ICE2Q659A1 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ICE2Q659A1 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ICE2Q659A1 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ICE2Q659A1 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ICE2Q659A1 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ICE2Q659A1 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ICE2Q659A1 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ICE2Q659A1 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ICE2Q659A1 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ICE2Q659A1 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ICE2Q659A1 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ICE2Q659A1 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ICE2Q659A1 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
ICE2Q659A1 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
ICE2Q659A1 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ICE2Q659A1 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ICE2Q659A1 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ICE2Q659A1 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ICE2Q659A1 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ICE2Q659A1 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ICE2Q659A1 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ICE2Q659A1 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ICE2Q659A1 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ICE2Q659A1 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ICE2Q659A1 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ICE2Q659A1 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ICE2Q659A1 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ICE2Q659A1 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ICE2Q659A1 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ICE2Q659A1 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ICE2Q659A1 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
ICE2Q659A1 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ICE2Q659A1 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ICE2Q659A1 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ICE2Q659A1 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ICE2Q659A1 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ICE2Q659A1 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ICE2Q659A1 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ICE2Q659A1 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ICE2Q659A1 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ICE2Q659A1 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ICE2Q659A1 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ICE2Q659A1 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ICE2Q659A1 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ICE2Q659A1 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ICE2Q659A1 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ICE2Q659A1 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ICE2Q659A1 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ICE2Q659A1 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ICE2Q659A1 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ICE2Q659A1 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ICE2Q659A1 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ICE2Q659A1 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ICE2Q659A1 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ICE2Q659A1 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ICE2Q659A1 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ICE2Q659A1 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ICE2Q659A1 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
ICE2Q659A1 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ICE2Q659A1 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ICE2Q659A1 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms