Protein–RNA interactions for Protein: Q5JRX3

PITRM1, Presequence protease, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,037 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITRM1Q5JRX3 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
PITRM1Q5JRX3 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PITRM1Q5JRX3 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
PITRM1Q5JRX3 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
PITRM1Q5JRX3 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
PITRM1Q5JRX3 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
PITRM1Q5JRX3 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
PITRM1Q5JRX3 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
PITRM1Q5JRX3 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
PITRM1Q5JRX3 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PITRM1Q5JRX3 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
PITRM1Q5JRX3 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PITRM1Q5JRX3 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
PITRM1Q5JRX3 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
PITRM1Q5JRX3 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PITRM1Q5JRX3 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PITRM1Q5JRX3 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
PITRM1Q5JRX3 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PITRM1Q5JRX3 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PITRM1Q5JRX3 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
PITRM1Q5JRX3 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PITRM1Q5JRX3 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
PITRM1Q5JRX3 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PITRM1Q5JRX3 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PITRM1Q5JRX3 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PITRM1Q5JRX3 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
PITRM1Q5JRX3 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PITRM1Q5JRX3 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PITRM1Q5JRX3 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PITRM1Q5JRX3 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PITRM1Q5JRX3 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PITRM1Q5JRX3 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PITRM1Q5JRX3 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PITRM1Q5JRX3 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PITRM1Q5JRX3 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PITRM1Q5JRX3 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PITRM1Q5JRX3 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PITRM1Q5JRX3 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PITRM1Q5JRX3 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PITRM1Q5JRX3 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PITRM1Q5JRX3 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PITRM1Q5JRX3 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
PITRM1Q5JRX3 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
PITRM1Q5JRX3 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PITRM1Q5JRX3 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PITRM1Q5JRX3 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PITRM1Q5JRX3 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PITRM1Q5JRX3 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PITRM1Q5JRX3 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PITRM1Q5JRX3 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PITRM1Q5JRX3 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PITRM1Q5JRX3 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PITRM1Q5JRX3 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
PITRM1Q5JRX3 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PITRM1Q5JRX3 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PITRM1Q5JRX3 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PITRM1Q5JRX3 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PITRM1Q5JRX3 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PITRM1Q5JRX3 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PITRM1Q5JRX3 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PITRM1Q5JRX3 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PITRM1Q5JRX3 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PITRM1Q5JRX3 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PITRM1Q5JRX3 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PITRM1Q5JRX3 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PITRM1Q5JRX3 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
PITRM1Q5JRX3 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
PITRM1Q5JRX3 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PITRM1Q5JRX3 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PITRM1Q5JRX3 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PITRM1Q5JRX3 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PITRM1Q5JRX3 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
PITRM1Q5JRX3 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PITRM1Q5JRX3 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PITRM1Q5JRX3 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PITRM1Q5JRX3 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PITRM1Q5JRX3 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PITRM1Q5JRX3 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PITRM1Q5JRX3 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PITRM1Q5JRX3 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PITRM1Q5JRX3 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PITRM1Q5JRX3 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PITRM1Q5JRX3 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
PITRM1Q5JRX3 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PITRM1Q5JRX3 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PITRM1Q5JRX3 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PITRM1Q5JRX3 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PITRM1Q5JRX3 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PITRM1Q5JRX3 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PITRM1Q5JRX3 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
PITRM1Q5JRX3 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PITRM1Q5JRX3 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.17
PITRM1Q5JRX3 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PITRM1Q5JRX3 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PITRM1Q5JRX3 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PITRM1Q5JRX3 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PITRM1Q5JRX3 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PITRM1Q5JRX3 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PITRM1Q5JRX3 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PITRM1Q5JRX3 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms