Protein–RNA interactions for Protein: Q5GLZ8

HERC4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,057 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC4Q5GLZ8 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
HERC4Q5GLZ8 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC32.08■■■□□ 2.73
HERC4Q5GLZ8 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
HERC4Q5GLZ8 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
HERC4Q5GLZ8 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
HERC4Q5GLZ8 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
HERC4Q5GLZ8 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
HERC4Q5GLZ8 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
HERC4Q5GLZ8 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
HERC4Q5GLZ8 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC31.95■■■□□ 2.71
HERC4Q5GLZ8 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC31.89■■■□□ 2.7
HERC4Q5GLZ8 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
HERC4Q5GLZ8 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
HERC4Q5GLZ8 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
HERC4Q5GLZ8 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
HERC4Q5GLZ8 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC31.84■■■□□ 2.69
HERC4Q5GLZ8 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC31.79■■■□□ 2.68
HERC4Q5GLZ8 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC31.79■■■□□ 2.68
HERC4Q5GLZ8 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
HERC4Q5GLZ8 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.77■■■□□ 2.68
HERC4Q5GLZ8 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
HERC4Q5GLZ8 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
HERC4Q5GLZ8 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
HERC4Q5GLZ8 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
HERC4Q5GLZ8 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.74■■■□□ 2.67
HERC4Q5GLZ8 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.74■■■□□ 2.67
HERC4Q5GLZ8 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
HERC4Q5GLZ8 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
HERC4Q5GLZ8 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
HERC4Q5GLZ8 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
HERC4Q5GLZ8 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
HERC4Q5GLZ8 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
HERC4Q5GLZ8 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
HERC4Q5GLZ8 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
HERC4Q5GLZ8 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC31.63■■■□□ 2.65
HERC4Q5GLZ8 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
HERC4Q5GLZ8 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
HERC4Q5GLZ8 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
HERC4Q5GLZ8 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
HERC4Q5GLZ8 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
HERC4Q5GLZ8 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC31.6■■■□□ 2.65
HERC4Q5GLZ8 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
HERC4Q5GLZ8 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
HERC4Q5GLZ8 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
HERC4Q5GLZ8 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
HERC4Q5GLZ8 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
HERC4Q5GLZ8 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
HERC4Q5GLZ8 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
HERC4Q5GLZ8 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
HERC4Q5GLZ8 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
HERC4Q5GLZ8 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
HERC4Q5GLZ8 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
HERC4Q5GLZ8 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
HERC4Q5GLZ8 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
HERC4Q5GLZ8 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
HERC4Q5GLZ8 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
HERC4Q5GLZ8 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
HERC4Q5GLZ8 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
HERC4Q5GLZ8 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
HERC4Q5GLZ8 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
HERC4Q5GLZ8 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
HERC4Q5GLZ8 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
HERC4Q5GLZ8 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
HERC4Q5GLZ8 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.62
HERC4Q5GLZ8 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
HERC4Q5GLZ8 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
HERC4Q5GLZ8 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC31.37■■■□□ 2.61
HERC4Q5GLZ8 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
HERC4Q5GLZ8 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
HERC4Q5GLZ8 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC31.36■■■□□ 2.61
HERC4Q5GLZ8 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
HERC4Q5GLZ8 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC31.33■■■□□ 2.61
HERC4Q5GLZ8 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC31.3■■■□□ 2.6
HERC4Q5GLZ8 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
HERC4Q5GLZ8 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
HERC4Q5GLZ8 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
HERC4Q5GLZ8 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
HERC4Q5GLZ8 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
HERC4Q5GLZ8 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC31.19■■■□□ 2.58
HERC4Q5GLZ8 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
HERC4Q5GLZ8 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
HERC4Q5GLZ8 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
HERC4Q5GLZ8 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC31.18■■■□□ 2.58
HERC4Q5GLZ8 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
HERC4Q5GLZ8 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC31.16■■■□□ 2.58
HERC4Q5GLZ8 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
HERC4Q5GLZ8 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
HERC4Q5GLZ8 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
HERC4Q5GLZ8 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
HERC4Q5GLZ8 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
HERC4Q5GLZ8 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
HERC4Q5GLZ8 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.1■■■□□ 2.57
HERC4Q5GLZ8 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
HERC4Q5GLZ8 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
HERC4Q5GLZ8 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
HERC4Q5GLZ8 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
HERC4Q5GLZ8 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC31.04■■■□□ 2.56
HERC4Q5GLZ8 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
HERC4Q5GLZ8 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
HERC4Q5GLZ8 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms