Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ANKRD39Q53RE8 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ANKRD39Q53RE8 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ANKRD39Q53RE8 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
ANKRD39Q53RE8 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ANKRD39Q53RE8 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ANKRD39Q53RE8 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ANKRD39Q53RE8 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ANKRD39Q53RE8 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ANKRD39Q53RE8 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ANKRD39Q53RE8 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ANKRD39Q53RE8 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ANKRD39Q53RE8 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ANKRD39Q53RE8 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ANKRD39Q53RE8 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ANKRD39Q53RE8 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ANKRD39Q53RE8 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ANKRD39Q53RE8 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ANKRD39Q53RE8 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ANKRD39Q53RE8 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ANKRD39Q53RE8 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ANKRD39Q53RE8 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
ANKRD39Q53RE8 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ANKRD39Q53RE8 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ANKRD39Q53RE8 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ANKRD39Q53RE8 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ANKRD39Q53RE8 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ANKRD39Q53RE8 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ANKRD39Q53RE8 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ANKRD39Q53RE8 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ANKRD39Q53RE8 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ANKRD39Q53RE8 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ANKRD39Q53RE8 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ANKRD39Q53RE8 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ANKRD39Q53RE8 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ANKRD39Q53RE8 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ANKRD39Q53RE8 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ANKRD39Q53RE8 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ANKRD39Q53RE8 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ANKRD39Q53RE8 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ANKRD39Q53RE8 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ANKRD39Q53RE8 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ANKRD39Q53RE8 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ANKRD39Q53RE8 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ANKRD39Q53RE8 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ANKRD39Q53RE8 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ANKRD39Q53RE8 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ANKRD39Q53RE8 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ANKRD39Q53RE8 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ANKRD39Q53RE8 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ANKRD39Q53RE8 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ANKRD39Q53RE8 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ANKRD39Q53RE8 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ANKRD39Q53RE8 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ANKRD39Q53RE8 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ANKRD39Q53RE8 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ANKRD39Q53RE8 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ANKRD39Q53RE8 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ANKRD39Q53RE8 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ANKRD39Q53RE8 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ANKRD39Q53RE8 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ANKRD39Q53RE8 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ANKRD39Q53RE8 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ANKRD39Q53RE8 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ANKRD39Q53RE8 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ANKRD39Q53RE8 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ANKRD39Q53RE8 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ANKRD39Q53RE8 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
ANKRD39Q53RE8 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ANKRD39Q53RE8 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ANKRD39Q53RE8 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ANKRD39Q53RE8 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ANKRD39Q53RE8 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ANKRD39Q53RE8 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ANKRD39Q53RE8 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ANKRD39Q53RE8 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ANKRD39Q53RE8 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
ANKRD39Q53RE8 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ANKRD39Q53RE8 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ANKRD39Q53RE8 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ANKRD39Q53RE8 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ANKRD39Q53RE8 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ANKRD39Q53RE8 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ANKRD39Q53RE8 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ANKRD39Q53RE8 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ANKRD39Q53RE8 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
ANKRD39Q53RE8 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ANKRD39Q53RE8 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ANKRD39Q53RE8 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ANKRD39Q53RE8 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ANKRD39Q53RE8 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ANKRD39Q53RE8 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ANKRD39Q53RE8 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
ANKRD39Q53RE8 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ANKRD39Q53RE8 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ANKRD39Q53RE8 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ANKRD39Q53RE8 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ANKRD39Q53RE8 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ANKRD39Q53RE8 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ANKRD39Q53RE8 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122.3 ms