Protein–RNA interactions for Protein: Q4VXA5

KHDC1, KH homology domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KHDC1Q4VXA5 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
KHDC1Q4VXA5 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
KHDC1Q4VXA5 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
KHDC1Q4VXA5 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
KHDC1Q4VXA5 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
KHDC1Q4VXA5 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
KHDC1Q4VXA5 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
KHDC1Q4VXA5 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
KHDC1Q4VXA5 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
KHDC1Q4VXA5 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
KHDC1Q4VXA5 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
KHDC1Q4VXA5 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
KHDC1Q4VXA5 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
KHDC1Q4VXA5 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
KHDC1Q4VXA5 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
KHDC1Q4VXA5 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
KHDC1Q4VXA5 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
KHDC1Q4VXA5 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
KHDC1Q4VXA5 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
KHDC1Q4VXA5 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
KHDC1Q4VXA5 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
KHDC1Q4VXA5 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
KHDC1Q4VXA5 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
KHDC1Q4VXA5 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
KHDC1Q4VXA5 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
KHDC1Q4VXA5 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
KHDC1Q4VXA5 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
KHDC1Q4VXA5 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
KHDC1Q4VXA5 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
KHDC1Q4VXA5 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
KHDC1Q4VXA5 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
KHDC1Q4VXA5 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
KHDC1Q4VXA5 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
KHDC1Q4VXA5 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
KHDC1Q4VXA5 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
KHDC1Q4VXA5 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
KHDC1Q4VXA5 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
KHDC1Q4VXA5 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
KHDC1Q4VXA5 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
KHDC1Q4VXA5 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
KHDC1Q4VXA5 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
KHDC1Q4VXA5 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
KHDC1Q4VXA5 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
KHDC1Q4VXA5 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
KHDC1Q4VXA5 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
KHDC1Q4VXA5 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
KHDC1Q4VXA5 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
KHDC1Q4VXA5 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
KHDC1Q4VXA5 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
KHDC1Q4VXA5 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
KHDC1Q4VXA5 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
KHDC1Q4VXA5 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
KHDC1Q4VXA5 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
KHDC1Q4VXA5 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
KHDC1Q4VXA5 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
KHDC1Q4VXA5 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
KHDC1Q4VXA5 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
KHDC1Q4VXA5 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
KHDC1Q4VXA5 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
KHDC1Q4VXA5 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
KHDC1Q4VXA5 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
KHDC1Q4VXA5 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
KHDC1Q4VXA5 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
KHDC1Q4VXA5 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
KHDC1Q4VXA5 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
KHDC1Q4VXA5 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
KHDC1Q4VXA5 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
KHDC1Q4VXA5 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
KHDC1Q4VXA5 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
KHDC1Q4VXA5 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
KHDC1Q4VXA5 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
KHDC1Q4VXA5 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
KHDC1Q4VXA5 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
KHDC1Q4VXA5 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
KHDC1Q4VXA5 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
KHDC1Q4VXA5 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
KHDC1Q4VXA5 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
KHDC1Q4VXA5 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
KHDC1Q4VXA5 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
KHDC1Q4VXA5 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
KHDC1Q4VXA5 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
KHDC1Q4VXA5 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
KHDC1Q4VXA5 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
KHDC1Q4VXA5 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
KHDC1Q4VXA5 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
KHDC1Q4VXA5 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
KHDC1Q4VXA5 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
KHDC1Q4VXA5 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
KHDC1Q4VXA5 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
KHDC1Q4VXA5 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
KHDC1Q4VXA5 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
KHDC1Q4VXA5 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
KHDC1Q4VXA5 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
KHDC1Q4VXA5 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
KHDC1Q4VXA5 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
KHDC1Q4VXA5 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
KHDC1Q4VXA5 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
KHDC1Q4VXA5 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
KHDC1Q4VXA5 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
KHDC1Q4VXA5 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms