Protein–RNA interactions for Protein: Q4KN68

LINC01620, Uncharacterized protein encoded by LINC01620, humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01620Q4KN68 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
LINC01620Q4KN68 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
LINC01620Q4KN68 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
LINC01620Q4KN68 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
LINC01620Q4KN68 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
LINC01620Q4KN68 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LINC01620Q4KN68 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LINC01620Q4KN68 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
LINC01620Q4KN68 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LINC01620Q4KN68 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LINC01620Q4KN68 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LINC01620Q4KN68 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
LINC01620Q4KN68 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
LINC01620Q4KN68 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
LINC01620Q4KN68 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
LINC01620Q4KN68 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
LINC01620Q4KN68 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
LINC01620Q4KN68 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
LINC01620Q4KN68 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
LINC01620Q4KN68 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
LINC01620Q4KN68 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
LINC01620Q4KN68 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
LINC01620Q4KN68 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
LINC01620Q4KN68 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
LINC01620Q4KN68 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
LINC01620Q4KN68 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
LINC01620Q4KN68 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
LINC01620Q4KN68 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
LINC01620Q4KN68 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
LINC01620Q4KN68 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
LINC01620Q4KN68 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
LINC01620Q4KN68 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LINC01620Q4KN68 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LINC01620Q4KN68 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LINC01620Q4KN68 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LINC01620Q4KN68 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LINC01620Q4KN68 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LINC01620Q4KN68 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LINC01620Q4KN68 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
LINC01620Q4KN68 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
LINC01620Q4KN68 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
LINC01620Q4KN68 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LINC01620Q4KN68 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LINC01620Q4KN68 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
LINC01620Q4KN68 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
LINC01620Q4KN68 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
LINC01620Q4KN68 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
LINC01620Q4KN68 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LINC01620Q4KN68 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LINC01620Q4KN68 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LINC01620Q4KN68 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LINC01620Q4KN68 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LINC01620Q4KN68 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LINC01620Q4KN68 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LINC01620Q4KN68 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LINC01620Q4KN68 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LINC01620Q4KN68 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
LINC01620Q4KN68 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LINC01620Q4KN68 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LINC01620Q4KN68 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LINC01620Q4KN68 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LINC01620Q4KN68 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LINC01620Q4KN68 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LINC01620Q4KN68 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LINC01620Q4KN68 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LINC01620Q4KN68 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LINC01620Q4KN68 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LINC01620Q4KN68 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LINC01620Q4KN68 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LINC01620Q4KN68 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LINC01620Q4KN68 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
LINC01620Q4KN68 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LINC01620Q4KN68 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LINC01620Q4KN68 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LINC01620Q4KN68 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LINC01620Q4KN68 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LINC01620Q4KN68 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LINC01620Q4KN68 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LINC01620Q4KN68 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LINC01620Q4KN68 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
LINC01620Q4KN68 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LINC01620Q4KN68 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LINC01620Q4KN68 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LINC01620Q4KN68 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
LINC01620Q4KN68 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
LINC01620Q4KN68 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LINC01620Q4KN68 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LINC01620Q4KN68 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LINC01620Q4KN68 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LINC01620Q4KN68 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LINC01620Q4KN68 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LINC01620Q4KN68 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LINC01620Q4KN68 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LINC01620Q4KN68 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LINC01620Q4KN68 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LINC01620Q4KN68 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LINC01620Q4KN68 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LINC01620Q4KN68 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LINC01620Q4KN68 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LINC01620Q4KN68 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms